單細(xì)胞及微量樣本的DNA甲基化組學(xué)研究很大程度上受制于建庫測序技術(shù)。傳統(tǒng)的文庫構(gòu)建方法或類似于基因組DNA的單細(xì)胞擴(kuò)增技術(shù)很難應(yīng)用到甲基化實(shí)驗(yàn)過程中。易基因建立了基于線性擴(kuò)增和單管建庫的技術(shù)，可充分降低文庫偏好性，準(zhǔn)確的完成珍貴樣本的全基因組甲基化研究。

單細(xì)胞及微量樣本的甲基化研究主要應(yīng)用于腫瘤發(fā)生機(jī)制，癌癥研究，胚胎植入前診斷，胚胎早期發(fā)育，生殖細(xì)胞重組，干細(xì)胞及細(xì)胞異質(zhì)性等研究領(lǐng)域。應(yīng)用的樣本包括單細(xì)胞、微量細(xì)胞等。

技術(shù)優(yōu)勢：

?  超低起始量：僅需大于5ng的DNA或微量的細(xì)胞；

?  樣本種類繁多：細(xì)胞、FFPE、cfDNA；

?  單堿基分辨率：可精確分析每一個(gè)C堿基的甲基化狀態(tài)。

實(shí)驗(yàn)策略：

分析內(nèi)容：

注：個(gè)性化分析、多組學(xué)關(guān)聯(lián)分析請聯(lián)系對接銷售或技術(shù)支持

送樣要求：

經(jīng)典案例

微量細(xì)胞樣本Micro DNA-BS繪制猴子植入前胚胎發(fā)育中的DNA甲基化圖譜

Gao F, et al. De novo DNA methylation during monkey pre-implantation embryogenesis. Cell Res. 2017 Apr;27(4):526-539. pii: cr201725.

1、背景

可能由于技術(shù)上的限制，還沒有研究揭示早期胚胎發(fā)育過程中的全基因組DNA再甲基化。

2、方法

利用具有超低DNA起始量（100個(gè)細(xì)胞）的微量細(xì)胞全基因組DNA甲基化測序技術(shù)（Micro DNA-BS）繪制靈長類動(dòng)物（恒河猴，Macaca mulatta）植入前胚胎發(fā)育的全基因組甲基化圖譜。

3、結(jié)論

本研究使用Micro DNA-BS對猴子早期胚胎發(fā)育過程的5mC進(jìn)行單堿基分辨率、高覆蓋率的甲基化分析。分析結(jié)果鑒定了發(fā)育過程中的全基因組DNA去甲基化和從頭甲基化，特別是在從2細(xì)胞到8細(xì)胞階段的過渡期間，研究全面闡明了DNA甲基化動(dòng)力學(xué)的“興衰”。此外，DNA甲基轉(zhuǎn)移酶敲降實(shí)驗(yàn)表明，異常的DNA甲基化會(huì)影響靈長類動(dòng)物早期胚胎的正常發(fā)育。本研究結(jié)果進(jìn)一步完善了目前關(guān)于哺乳動(dòng)物DNA甲基化重編程的知識體系，并為未來靈長類動(dòng)物胚胎發(fā)育的研究提供了寶貴的數(shù)據(jù)資源。

成對比較揭示植入前胚胎發(fā)育過程中全基因組DNA去甲基化和從頭甲基化

參考文獻(xiàn)：

①     DOI:10.1038/cr.2017.25