4D-DIA如何提升復(fù)雜樣本中的蛋白識別率？檢測技術(shù)服務(wù)詳情介紹

在蛋白組學(xué)研究中，樣本復(fù)雜性是影響數(shù)據(jù)質(zhì)量的關(guān)鍵因素。無論是組織樣本、體液樣本，還是固定保存的臨床材料，其共同特點都是蛋白種類繁多、豐度跨度大、干擾物多，給dànbáizhì識別和定量帶來巨大挑戰(zhàn)。數(shù)據(jù)非依賴采集（DIA）技術(shù)雖然具備高重現(xiàn)性和高通量，但在面對復(fù)雜背景時仍存在蛋白識別率偏低、低豐度蛋白難以覆蓋等問題。近年來，4D-DIA（四維數(shù)據(jù)非依賴采集）技術(shù)的興起，為解決這一問題提供了全新思路。該技術(shù)通過引入“離子淌度”作為第四維度，有效提升了復(fù)雜背景下的譜圖分辨率和肽段識別率。

一、4D-DIA：加入“離子淌度”的四維質(zhì)譜分析

DIA是一種面向全掃描的質(zhì)譜采集策略，避免了依賴DDA（數(shù)據(jù)依賴采集）中隨機(jī)挑選母離子的局限性。然而，在復(fù)雜樣本中，多個肽段可能在同一窗口內(nèi)共洗脫，產(chǎn)生譜圖重疊，影響肽段的jīngquè識別。4D-DIA在三維基礎(chǔ)上（保留時間、質(zhì)荷比、離子強(qiáng)度），引入離子淌度（Ion Mobility）這一物理分離維度。其核心是利用電場對帶電肽段在高壓氣流中進(jìn)行分離，不同結(jié)構(gòu)和形狀的肽段具有不同的淌度值，從而實現(xiàn)比色譜更細(xì)致的肽段區(qū)分。這種技術(shù)通常依托如Bruker timsTOF等設(shè)備完成，能夠在不顯著犧牲速度的前提下，獲得更純凈、更高質(zhì)量的譜圖。

二、4D-DIA如何提升蛋白識別率？

1、減少共洗脫干擾，提高譜圖純凈度

離子淌度分離使得在質(zhì)荷比和保留時間重合的情況下，不同肽段仍能被準(zhǔn)確區(qū)分，從而減少譜圖重疊和干擾，提高匹配效率。

2、提升低豐度蛋白識別能力

在常規(guī)DIA中，低豐度肽段往往被高豐度離子的信號覆蓋。4D-DIA通過分離更多維度的特征，使得原本被掩蓋的信號得以顯現(xiàn)，增強(qiáng)低豐度蛋白的檢測能力。

3、增強(qiáng)定量線性范圍和重復(fù)性

4D-DIA提升了信號解卷積精度，使得在復(fù)雜背景中仍可實現(xiàn)良好的定量一致性，尤其適用于生物學(xué)重復(fù)樣本的大規(guī)模篩查。

4、適配優(yōu)良AI識別算法

如DIA-NN等軟件已原生支持4D數(shù)據(jù)格式，結(jié)合深度學(xué)習(xí)模型進(jìn)一步提升譜圖解讀效率，使4D-DIA成為復(fù)雜樣本組學(xué)研究的強(qiáng)力引擎。

三、4D-DIA應(yīng)用于哪些復(fù)雜樣本類型更具優(yōu)勢？

4D-DIA對大多數(shù)蛋白組樣本都有良好的適配性，尤其在以下幾類中優(yōu)勢更加突出：

• 血清/血漿等體液樣本：動態(tài)范圍大，4D-DIA可提升低豐度信號檢測。

• 石蠟包埋組織（FFPE）樣本：蛋白交聯(lián)和降解嚴(yán)重，需更高分辨率譜圖解析。

• 外泌體/細(xì)胞間小體樣本：目標(biāo)蛋白豐度低，背景復(fù)雜。

• 異質(zhì)性組織（如腫瘤）：細(xì)胞亞群差異顯著，4D分離可提高分型準(zhǔn)確度。

4D-DIA通過引入離子淌度維度，顯著提高了復(fù)雜背景下的蛋白識別效率、定量準(zhǔn)確性和低豐度蛋白覆蓋能力，成為當(dāng)前蛋白組學(xué)研究的熱點方向。特別是在面對高異質(zhì)性、高動態(tài)范圍和高背景干擾的樣本時，其表現(xiàn)尤為出色。隨著軟硬件生態(tài)的不斷成熟，4D-DIA將在疾病標(biāo)志物篩選、jīngzhǔn醫(yī)療、免疫研究、空間蛋白組等方向發(fā)揮日益重要的作用。百泰派克生物科技致力于提供高質(zhì)量的DIA定量dànbáizhì組學(xué)服務(wù)，無論是基礎(chǔ)研究、藥物機(jī)制解析，還是臨床樣本隊列研究，我們都能為您提供zhídexìnlài的技術(shù)支持。

百泰派克生物科技特色項目

一、蛋白測序

百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos質(zhì)譜儀及島津公司埃德曼降解測序系統(tǒng)對dànbáizhì序列進(jìn)行分析，提供基于質(zhì)譜的蛋白測序分析服務(wù)，包括對dànbáizhì的氨基酸組成分析，Nduāncèxù，Cduāncèxù和全序列分析，以及基于埃德曼降解的dànbáizhìN端序列分析服務(wù)。對于未知理論序列的dànbáizhì，提供基于從頭測序法的dànbáizhì從頭測序服務(wù)，對蛋白序列進(jìn)行分析。

※服務(wù)優(yōu)勢：

1.采用目前世界上優(yōu)良的質(zhì)譜儀器 Obitrap Fusion Lumos;

2.可實現(xiàn)對所測定靶蛋白序列 100% 的覆蓋;

3.可測定蛋白N端多達(dá) 70個氨基酸序列;

4.可測定多種形式的樣品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白條帶;

5.樣品用量低: 蛋白樣品僅需 5-10ug，即可完成檢測;

6.測序不受N端封閉，PEC和和糖基化等N端修飾的影響。

二、dànbáizhì組學(xué)

百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos質(zhì)譜平臺結(jié)合Nano-LC，提供定量dànbáizhì組學(xué)、靶向dànbáizhì組學(xué)、多肽組學(xué)、翻譯后修飾蛋白組學(xué)等多種dànbáizhì組學(xué)分析服務(wù)。此外，百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4Ddànbáizhì組學(xué)服務(wù)，助力微量樣本蛋白組學(xué)、大樣本群醫(yī)學(xué)及高通量修飾組學(xué)等研究工作。

※服務(wù)優(yōu)勢：

1 .高通量定量蛋白分析:多對照組大規(guī)模實驗分析，發(fā)現(xiàn)新的生物標(biāo)記物;

2.體內(nèi)體外多種dànbáizhì標(biāo)記方法，適用于分析組織、細(xì)胞、血液等多種樣品;

3.質(zhì)譜分析靈敏度高，實驗結(jié)果重復(fù)度高;

4.可檢測較低豐度蛋白，線性范圍廣;

5.zhuānyè生物信息學(xué)分析，分析更系統(tǒng)準(zhǔn)確。

三、單細(xì)胞質(zhì)譜流式技術(shù)分析

百泰派克生物科技采用Fluidigm質(zhì)譜流式系統(tǒng)進(jìn)行單細(xì)胞質(zhì)譜流式技術(shù)分析，采用金屬元素標(biāo)記物（通常是金屬元素標(biāo)記的特異抗體）標(biāo)記細(xì)胞表面和內(nèi)部的分子，然后用流式細(xì)胞原理分離單個細(xì)胞，再用電感耦合等離子體質(zhì)譜（ICP-MS）分析單個細(xì)胞的原子質(zhì)量譜，zuì后將原子質(zhì)量譜數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換為細(xì)胞表面和內(nèi)部的信號分子表達(dá)量。

※服務(wù)優(yōu)勢：

1.技術(shù)優(yōu)良，*技術(shù)空白

采用金屬標(biāo)記抗體技術(shù)，避免了傳統(tǒng)流式熒光通道少且易相互影響的問題。可在單細(xì)胞層面上對多種指標(biāo)同時進(jìn)行表征，百泰派克生物科技可做到同時檢測51個目標(biāo)蛋白。

2.分析數(shù)量大，成本較低

單細(xì)胞RNAseq受成本等因素限制，所有樣本細(xì)胞匯總的分析數(shù)目一般在2x10^4個左右，而流式質(zhì)譜技術(shù)一次（單樣本）就可分析至少10^5的細(xì)胞，實現(xiàn)了數(shù)量級的提高，且成本不高于單細(xì)胞RNAseq。

3.應(yīng)用前景大

①流式質(zhì)譜結(jié)果可以給出細(xì)胞亞群的變化，在臨床診斷、疾病機(jī)制研究等方面具有極大的研究前景；

②將金屬標(biāo)簽技術(shù)與其他技術(shù)結(jié)合會有新應(yīng)用方向。除常規(guī)蛋白外，質(zhì)譜流式細(xì)胞技術(shù)還可用于蛋白翻譯后修飾；

③可檢測細(xì)胞存活率、細(xì)胞大小、mRNA轉(zhuǎn)錄子表達(dá)量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。

四、基于高精度質(zhì)譜的免疫多肽組學(xué)分析及新抗原發(fā)現(xiàn)

百泰派克生物科技的基于高精度質(zhì)譜的免疫多肽組學(xué)分析及新抗原發(fā)現(xiàn)一站式解決方案包括我們專有的、高度敏感的免疫肽富集和鑒定方案。我們能夠幫助您實現(xiàn)10,000個以上I型多肽和10,000個以上II型多肽的鑒定和識別。通過我們優(yōu)化的高通量免疫多肽組學(xué)分析平臺進(jìn)行免疫肽組學(xué)分析，可從zuì小的樣品材料中進(jìn)行可重復(fù)的識別和定量。該服務(wù)可以應(yīng)用于大規(guī)模的研究，旨在助力科研工作者尋找癌癥、免疫疾病及傳染病的解決方案，深入挖掘未知的靶標(biāo)。

五、生物藥物表征

百泰派克基于高分辨率質(zhì)譜技術(shù)，MALDI TOF，高效色譜分離技術(shù)，提供一系列完善的生物藥物分析方案，從dànbáizhì、多肽、抗體、疫苗等生物制品的氨基酸組成和一級結(jié)構(gòu)分析，到產(chǎn)品變異性和純度分析。旨在提供優(yōu)質(zhì)生物藥物分析服務(wù)，幫助生物醫(yī)藥生產(chǎn)商提高生物藥物品質(zhì)。

百泰派克生物科技七大檢測平臺

百泰派克生物科技-生物制品表征，生物質(zhì)譜多組學(xué)優(yōu)質(zhì)服務(wù)商

北京百泰派克生物科技有限公司致力于為生物/制藥和醫(yī)療器械行業(yè)提供質(zhì)量控制檢測和項目驗證等zhuānyè服務(wù)。公司實驗室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法規(guī)和指導(dǎo)原則，通過CNAS/ISO9001雙重質(zhì)量體系認(rèn)證，建立了完備的質(zhì)量體系，數(shù)據(jù)冷熱/異地備份，設(shè)備定期計量/期間核查，軟件審計追蹤，為客戶提供一體化解決方案和技術(shù)服務(wù)，支持新藥研發(fā)、藥物申報注冊和生產(chǎn)放行。

1.公司采用ISO9001質(zhì)量控制體系，zhuānyè提供以質(zhì)譜為基礎(chǔ)的CRO檢測分析服務(wù)；

2.獲國家CNAS實驗室認(rèn)可，為客戶提供符合全球藥政法規(guī)的藥物質(zhì)量研究服務(wù)；

3.業(yè)務(wù)范圍覆蓋dànbáizhì組學(xué)、多肽組學(xué)、代謝組學(xué)、生物藥物表征、單細(xì)胞分析、單細(xì)胞質(zhì)譜流式、生信云分析以及多組學(xué)生物質(zhì)譜整合分析等；

4.七大質(zhì)量控制檢測平臺，滿足您一站式服務(wù)需求；

5.服務(wù)3000+企業(yè)，10000+客戶的選擇；

6.致力于為您提供優(yōu)質(zhì)的生物質(zhì)譜分析服務(wù)!

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