利用化學(xué)蛋白質(zhì)組學(xué)揭示蛋白-配體相互作用檢測技術(shù)服務(wù)詳情介紹

在細(xì)胞內(nèi)，幾乎所有的生物過程都離不開dànbáizhì與配體的相互作用（protein-ligand interactions）。這些配體可以是小分子藥物、代謝物、脂類、甚至金屬離子。深入理解這些相互作用不僅有助于揭示信號通路、調(diào)控機(jī)制和疾病機(jī)制，更是藥物發(fā)現(xiàn)、靶點(diǎn)驗(yàn)證以及機(jī)制研究的關(guān)鍵一步。然而，蛋白-配體相互作用具有動態(tài)性強(qiáng)、特異性高、背景復(fù)雜等特點(diǎn)，傳統(tǒng)的親和層析、生化驗(yàn)證手段難以實(shí)現(xiàn)高通量、全譜級的篩查和定量。在這一背景下，化學(xué)dànbáizhì組學(xué)（Chemical Proteomics）作為一項融合了有機(jī)化學(xué)、dànbáizhì組學(xué)和質(zhì)譜分析的交叉學(xué)科技術(shù)，正日益成為研究蛋白-配體互作的新利器。

一、什么是化學(xué)dànbáizhì組學(xué)？

化學(xué)dànbáizhì組學(xué)是一種基于小分子探針和高分辨質(zhì)譜的靶標(biāo)識別策略，能夠在細(xì)胞或組織背景下篩選與特定配體結(jié)合的dànbáizhì群體。

其核心流程包括：

• 設(shè)計并合成帶有標(biāo)簽的配體衍生物（通常是活性探針，如共價探針、光交聯(lián)探針）

• 與活細(xì)胞或裂解物孵育，使探針與靶蛋白發(fā)生特異性結(jié)合

• 富集結(jié)合蛋白（如利用shēngwùsù-鏈霉親和素系統(tǒng)）

• 經(jīng)酶解后用LC-MS/MS鑒定結(jié)合蛋白，并進(jìn)行定量比較

這一技術(shù)的zuì大優(yōu)勢在于可以在復(fù)雜生理背景中原位捕捉配體結(jié)合蛋白，不僅保留天然構(gòu)象和微環(huán)境，也避免了純化過程中相互作用的丟失。

二、化學(xué)dànbáizhì組學(xué)的核心策略與技術(shù)類型

1、活性位點(diǎn)標(biāo)記（Activity-Based Protein Profiling, ABPP）

通過設(shè)計能夠共價修飾蛋白活性位點(diǎn)的探針，ABPP可jīngzhǔn捕捉功能性dànbáizhì，尤其適用于水解酶、氧化還原酶等。

• 常用的探針結(jié)構(gòu)：親核反應(yīng)團(tuán) + 報告標(biāo)簽 + 骨架

• 可與定量質(zhì)譜（如SILAC、TMT）聯(lián)用，實(shí)現(xiàn)高通量篩選

2、光交聯(lián)探針（Photoaffinity Labeling）

光交聯(lián)探針通過紫外光照射產(chǎn)生短壽命的高活性中間體，與靶蛋白形成不可逆的共價鍵，適合研究瞬時性、弱相互作用。

• 常用光交聯(lián)基團(tuán)：芳基氮烯（Ar-N3）、苯重氮鹽等

• 與同位素標(biāo)記或label-free方法結(jié)合，提升定量能力

3、競爭結(jié)合實(shí)驗(yàn)（Competitive Binding）

將帶標(biāo)簽的探針與非標(biāo)記配體進(jìn)行競爭實(shí)驗(yàn)，可用于驗(yàn)證配體特異性，識別真正靶點(diǎn)vs非特異結(jié)合蛋白。

三、典型應(yīng)用場景

1、藥物靶點(diǎn)識別與驗(yàn)證

在新藥研發(fā)過程中，快速準(zhǔn)確地識別候選化合物的作用靶點(diǎn)是機(jī)制研究與結(jié)構(gòu)優(yōu)化的基礎(chǔ)?；瘜W(xué)dànbáizhì組學(xué)可在細(xì)胞內(nèi)原位捕捉與小分子藥物結(jié)合的dànbáizhì群體，為靶點(diǎn)驗(yàn)證與脫靶分析提供高通量解決方案。

2、天然產(chǎn)物機(jī)制解析

天然產(chǎn)物具有高度結(jié)構(gòu)多樣性，其作用機(jī)制往往難以預(yù)測。通過結(jié)合共價或光交聯(lián)探針，化學(xué)dànbáizhì組學(xué)能夠幫助研究人員全面揭示天然產(chǎn)物與dànbáizhì的互作譜，挖掘潛在治療靶標(biāo)。

3、表型篩選后的靶點(diǎn)反推

高內(nèi)涵篩選等表型導(dǎo)向策略常能篩選出功能活性分子，但具體靶點(diǎn)不明確。化學(xué)dànbáizhì組學(xué)可用于反推這些分子的蛋白結(jié)合靶點(diǎn)，加快從“表型到機(jī)制”的轉(zhuǎn)化效率。

4、毒理學(xué)與環(huán)境暴露研究

某些藥物代謝產(chǎn)物、環(huán)境毒素或內(nèi)源代謝物可能通過與dànbáizhì的結(jié)合引發(fā)毒性反應(yīng)。利用化學(xué)dànbáizhì組學(xué)可系統(tǒng)性評估這些分子與蛋白互作帶來的功能擾動，揭示毒性機(jī)制。

四、技術(shù)優(yōu)勢與挑戰(zhàn)并存

1、優(yōu)勢

• 高通量：一次實(shí)驗(yàn)可識別上百個潛在靶標(biāo)

• 原位性強(qiáng)：保持天然相互作用背景

• 特異性好：結(jié)合探針結(jié)構(gòu)優(yōu)化提高識別能力

• 易于定量：可結(jié)合多種質(zhì)譜定量策略

2、挑戰(zhàn)

• 探針設(shè)計要求高：需兼顧親和力、反應(yīng)活性與細(xì)胞通透性

• 背景噪音干擾：需合理設(shè)置對照組與統(tǒng)計閾值

• 數(shù)據(jù)解讀復(fù)雜：需整合dànbáizhì功能注釋、通路分析等生信手段

化學(xué)dànbáizhì組學(xué)的興起，為破解蛋白-配體相互作用提供了全新視角。其兼具高通量、原位性和特異性的特質(zhì)，已成為現(xiàn)代藥物研發(fā)與機(jī)制探索bùkěhuòquē的關(guān)鍵工具。百泰派克生物科技化學(xué)dànbáizhì組學(xué)全面解決方案包括從實(shí)驗(yàn)設(shè)計、樣品制備、探針合成、靶標(biāo)鑒定以及數(shù)據(jù)分析的全流程，為您提供一站式的無憂服務(wù)，滿足您在藥物開發(fā)和藥物發(fā)現(xiàn)領(lǐng)域生物標(biāo)志物研究、藥物和靶點(diǎn)發(fā)現(xiàn)、通路建模、藥物作用研究等的多種需求。

百泰派克生物科技特色項目

一、蛋白測序

百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos質(zhì)譜儀及島津公司埃德曼降解測序系統(tǒng)對dànbáizhì序列進(jìn)行分析，提供基于質(zhì)譜的蛋白測序分析服務(wù)，包括對dànbáizhì的氨基酸組成分析，Nduāncèxù，Cduāncèxù和全序列分析，以及基于埃德曼降解的dànbáizhìN端序列分析服務(wù)。對于未知理論序列的dànbáizhì，提供基于從頭測序法的dànbáizhì從頭測序服務(wù)，對蛋白序列進(jìn)行分析。

※服務(wù)優(yōu)勢：

1.采用目前世界上優(yōu)良的質(zhì)譜儀器 Obitrap Fusion Lumos;

2.可實(shí)現(xiàn)對所測定靶蛋白序列 100% 的覆蓋;

3.可測定蛋白N端多達(dá) 70個氨基酸序列;

4.可測定多種形式的樣品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白條帶;

5.樣品用量低: 蛋白樣品僅需 5-10ug，即可完成檢測;

6.測序不受N端封閉，PEC和和糖基化等N端修飾的影響。

二、dànbáizhì組學(xué)

百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos質(zhì)譜平臺結(jié)合Nano-LC，提供定量dànbáizhì組學(xué)、靶向dànbáizhì組學(xué)、多肽組學(xué)、翻譯后修飾蛋白組學(xué)等多種dànbáizhì組學(xué)分析服務(wù)。此外，百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4Ddànbáizhì組學(xué)服務(wù)，助力微量樣本蛋白組學(xué)、大樣本群醫(yī)學(xué)及高通量修飾組學(xué)等研究工作。

※服務(wù)優(yōu)勢：

1 .高通量定量蛋白分析:多對照組大規(guī)模實(shí)驗(yàn)分析，發(fā)現(xiàn)新的生物標(biāo)記物;

2.體內(nèi)體外多種dànbáizhì標(biāo)記方法，適用于分析組織、細(xì)胞、血液等多種樣品;

3.質(zhì)譜分析靈敏度高，實(shí)驗(yàn)結(jié)果重復(fù)度高;

4.可檢測較低豐度蛋白，線性范圍廣;

5.zhuānyè生物信息學(xué)分析，分析更系統(tǒng)準(zhǔn)確。

三、單細(xì)胞質(zhì)譜流式技術(shù)分析

百泰派克生物科技采用Fluidigm質(zhì)譜流式系統(tǒng)進(jìn)行單細(xì)胞質(zhì)譜流式技術(shù)分析，采用金屬元素標(biāo)記物（通常是金屬元素標(biāo)記的特異抗體）標(biāo)記細(xì)胞表面和內(nèi)部的分子，然后用流式細(xì)胞原理分離單個細(xì)胞，再用電感耦合等離子體質(zhì)譜（ICP-MS）分析單個細(xì)胞的原子質(zhì)量譜，zuì后將原子質(zhì)量譜數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換為細(xì)胞表面和內(nèi)部的信號分子表達(dá)量。

※服務(wù)優(yōu)勢：

1.技術(shù)優(yōu)良，*技術(shù)空白

采用金屬標(biāo)記抗體技術(shù)，避免了傳統(tǒng)流式熒光通道少且易相互影響的問題。可在單細(xì)胞層面上對多種指標(biāo)同時進(jìn)行表征，百泰派克生物科技可做到同時檢測51個目標(biāo)蛋白。

2.分析數(shù)量大，成本較低

單細(xì)胞RNAseq受成本等因素限制，所有樣本細(xì)胞匯總的分析數(shù)目一般在2x10^4個左右，而流式質(zhì)譜技術(shù)一次（單樣本）就可分析至少10^5的細(xì)胞，實(shí)現(xiàn)了數(shù)量級的提高，且成本不高于單細(xì)胞RNAseq。

3.應(yīng)用前景大

①流式質(zhì)譜結(jié)果可以給出細(xì)胞亞群的變化，在臨床診斷、疾病機(jī)制研究等方面具有極大的研究前景；

②將金屬標(biāo)簽技術(shù)與其他技術(shù)結(jié)合會有新應(yīng)用方向。除常規(guī)蛋白外，質(zhì)譜流式細(xì)胞技術(shù)還可用于蛋白翻譯后修飾；

③可檢測細(xì)胞存活率、細(xì)胞大小、mRNA轉(zhuǎn)錄子表達(dá)量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。

四、基于高精度質(zhì)譜的免疫多肽組學(xué)分析及新抗原發(fā)現(xiàn)

百泰派克生物科技的基于高精度質(zhì)譜的免疫多肽組學(xué)分析及新抗原發(fā)現(xiàn)一站式解決方案包括我們專有的、高度敏感的免疫肽富集和鑒定方案。我們能夠幫助您實(shí)現(xiàn)10,000個以上I型多肽和10,000個以上II型多肽的鑒定和識別。通過我們優(yōu)化的高通量免疫多肽組學(xué)分析平臺進(jìn)行免疫肽組學(xué)分析，可從zuì小的樣品材料中進(jìn)行可重復(fù)的識別和定量。該服務(wù)可以應(yīng)用于大規(guī)模的研究，旨在助力科研工作者尋找癌癥、免疫疾病及傳染病的解決方案，深入挖掘未知的靶標(biāo)。

五、生物藥物表征

百泰派克基于高分辨率質(zhì)譜技術(shù)，MALDI TOF，高效色譜分離技術(shù)，提供一系列完善的生物藥物分析方案，從dànbáizhì、多肽、抗體、疫苗等生物制品的氨基酸組成和一級結(jié)構(gòu)分析，到產(chǎn)品變異性和純度分析。旨在提供優(yōu)質(zhì)生物藥物分析服務(wù)，幫助生物醫(yī)藥生產(chǎn)商提高生物藥物品質(zhì)。

百泰派克生物科技七大檢測平臺

百泰派克生物科技-生物制品表征，生物質(zhì)譜多組學(xué)優(yōu)質(zhì)服務(wù)商

北京百泰派克生物科技有限公司致力于為生物/制藥和醫(yī)療器械行業(yè)提供質(zhì)量控制檢測和項目驗(yàn)證等zhuānyè服務(wù)。公司實(shí)驗(yàn)室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法規(guī)和指導(dǎo)原則，通過CNAS/ISO9001雙重質(zhì)量體系認(rèn)證，建立了完備的質(zhì)量體系，數(shù)據(jù)冷熱/異地備份，設(shè)備定期計量/期間核查，軟件審計追蹤，為客戶提供一體化解決方案和技術(shù)服務(wù)，支持新藥研發(fā)、藥物申報注冊和生產(chǎn)放行。

1.公司采用ISO9001質(zhì)量控制體系，zhuānyè提供以質(zhì)譜為基礎(chǔ)的CRO檢測分析服務(wù)；

2.獲國家CNAS實(shí)驗(yàn)室認(rèn)可，為客戶提供符合全球藥政法規(guī)的藥物質(zhì)量研究服務(wù)；

3.業(yè)務(wù)范圍覆蓋dànbáizhì組學(xué)、多肽組學(xué)、代謝組學(xué)、生物藥物表征、單細(xì)胞分析、單細(xì)胞質(zhì)譜流式、生信云分析以及多組學(xué)生物質(zhì)譜整合分析等；

4.七大質(zhì)量控制檢測平臺，滿足您一站式服務(wù)需求；

5.服務(wù)3000+企業(yè)，10000+客戶的選擇；

6.致力于為您提供優(yōu)質(zhì)的生物質(zhì)譜分析服務(wù)!

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