細(xì)胞表面蛋白質(zhì)組學(xué)分析檢測(cè)技術(shù)服務(wù)詳情介紹

細(xì)胞是生命活動(dòng)的基本單元，而細(xì)胞表面則是其感知、識(shí)別和響應(yīng)外界環(huán)境的前沿陣地。細(xì)胞表面蛋白廣泛參與信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)、物質(zhì)轉(zhuǎn)運(yùn)、細(xì)胞識(shí)別和黏附等過(guò)程，是連接細(xì)胞內(nèi)外環(huán)境的關(guān)鍵橋梁。細(xì)胞表面dànbáizhì組學(xué)（surface proteomics）可以系統(tǒng)了解這些蛋白在不同生理和病理狀態(tài)下的變化。通過(guò)高通量手段對(duì)細(xì)胞表面蛋白進(jìn)行全面鑒定和定量，研究人員能夠深入解析細(xì)胞狀態(tài)、識(shí)別功能亞群，并挖掘潛在的干預(yù)靶點(diǎn)。

一、細(xì)胞表面蛋白的研究?jī)r(jià)值

1、關(guān)鍵的細(xì)胞功能執(zhí)行者

細(xì)胞表面蛋白不僅是細(xì)胞與外界環(huán)境的物理接觸點(diǎn)，更承擔(dān)著信息接收與傳遞、細(xì)胞間識(shí)別、組織構(gòu)建與免疫調(diào)控等重要功能。在發(fā)育、生理穩(wěn)態(tài)與疾病進(jìn)展中，其表達(dá)譜和功能狀態(tài)常常呈現(xiàn)出高度動(dòng)態(tài)變化。

2、多種研究場(chǎng)景的理想靶點(diǎn)

表面蛋白通常具有跨膜結(jié)構(gòu)和胞外可識(shí)別區(qū)域，因此極易成為診斷標(biāo)志物和干預(yù)靶點(diǎn)。無(wú)論是在基礎(chǔ)研究中識(shí)別細(xì)胞亞型，還是在應(yīng)用研究中尋找藥物作用位點(diǎn)，表面蛋白都發(fā)揮著bùkětìdài的作用。

二、細(xì)胞表面蛋白組學(xué)的研究策略

1、富集技術(shù)

細(xì)胞表面蛋白在全細(xì)胞蛋白中比例極低，且多為疏水性強(qiáng)、跨膜結(jié)構(gòu)復(fù)雜的膜蛋白，因此在進(jìn)入質(zhì)譜分析前，必須進(jìn)行有效的選擇性富集。常用策略包括：

• shēngwùsù化化學(xué)標(biāo)記法：選擇性標(biāo)記胞外區(qū)域賴氨酸殘基，通過(guò)親和捕獲將表面蛋白從總蛋白中分離。

• 代謝標(biāo)記法：通過(guò)培養(yǎng)基中的特殊化合物引入可反應(yīng)基團(tuán)，間接標(biāo)記并富集細(xì)胞膜表面糖蛋白或其他結(jié)構(gòu)蛋白。

• 細(xì)胞表面剝離法：溫和釋放表面蛋白或片段，避免胞內(nèi)蛋白污染，適用于對(duì)膜完整性要求較高的實(shí)驗(yàn)體系。

這些方法可根據(jù)樣本類型、研究目標(biāo)和質(zhì)譜平臺(tái)特性靈活選擇與優(yōu)化。

2、高分辨率質(zhì)譜

富集后的表面蛋白經(jīng)酶解生成肽段，隨后進(jìn)入高分辨率質(zhì)譜平臺(tái)進(jìn)行分析。常用的數(shù)據(jù)采集模式包括DDA（Data Dependent Acquisition）和DIA（Data Independent Acquisition），DIA在數(shù)據(jù)完整性和重現(xiàn)性方面具有優(yōu)勢(shì)。在質(zhì)譜識(shí)別結(jié)果基礎(chǔ)上，結(jié)合跨膜結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)工具（如TMHMM、Phobius）和亞細(xì)胞定位數(shù)據(jù)庫(kù)注釋，可以jīngzhǔn篩選真正定位于細(xì)胞膜表面的dànbáizhì，從而提升生物學(xué)解釋的可靠性。

3、數(shù)據(jù)分析策略

細(xì)胞表面蛋白組數(shù)據(jù)通常用于：

• 差異表達(dá)分析：識(shí)別不同條件下特異表達(dá)或上調(diào)的表面蛋白；

• 聚類與分群分析：結(jié)合多樣本或多時(shí)間點(diǎn)數(shù)據(jù)，劃分功能相近或狀態(tài)相似的細(xì)胞亞群；

• 通路富集與功能注釋：解析表面蛋白所涉及的通路與調(diào)控網(wǎng)絡(luò)，結(jié)合已有文獻(xiàn)支持構(gòu)建調(diào)控模型。

三、細(xì)胞表面蛋白組學(xué)的主要應(yīng)用方向

1、細(xì)胞狀態(tài)表征與亞群識(shí)別

不同類型或狀態(tài)的細(xì)胞往往具有差異化的表面蛋白表達(dá)譜，通過(guò)高通量分析可構(gòu)建表面標(biāo)志物圖譜，用于表征細(xì)胞功能狀態(tài)、識(shí)別稀有亞群或追蹤細(xì)胞命運(yùn)演變。在干細(xì)胞研究、組織發(fā)育、生物過(guò)程動(dòng)態(tài)監(jiān)測(cè)等場(chǎng)景中，表面蛋白數(shù)據(jù)有助于建立更準(zhǔn)確的細(xì)胞分類系統(tǒng)，尤其是在缺乏明確轉(zhuǎn)錄標(biāo)志的體系中，其優(yōu)勢(shì)尤為突出。

2、信號(hào)網(wǎng)絡(luò)解析與機(jī)制研究

細(xì)胞如何感知外界信號(hào)、如何整合多種刺激并作出反應(yīng)，往往依賴表面蛋白與配體之間的相互作用。通過(guò)系統(tǒng)性表面蛋白組學(xué)分析，可以挖掘潛在的信號(hào)通路調(diào)控節(jié)點(diǎn)，并探索它們?cè)诩?xì)胞行為調(diào)節(jié)中的具體角色。這對(duì)構(gòu)建動(dòng)態(tài)信號(hào)傳導(dǎo)圖譜、理解應(yīng)激響應(yīng)機(jī)制、分析疾病驅(qū)動(dòng)因子等具有重要意義。

3、生物標(biāo)志物篩選與靶向干預(yù)探索

相較于胞內(nèi)蛋白，細(xì)胞表面蛋白更適合作為臨床診斷和藥物作用靶點(diǎn)。表面蛋白的表達(dá)變化可直接反映細(xì)胞病理狀態(tài)，有助于發(fā)現(xiàn)疾病早期預(yù)警指標(biāo)或療效預(yù)測(cè)因子。此外，在藥物開(kāi)發(fā)中，系統(tǒng)性表面蛋白組數(shù)據(jù)可用于篩選特異性靶點(diǎn)，構(gòu)建干預(yù)策略，特別適合應(yīng)用于抗體類藥物、細(xì)胞治療或靶向遞送系統(tǒng)的設(shè)計(jì)。

細(xì)胞表面蛋白組學(xué)不僅是蛋白組學(xué)的一個(gè)分支，更是解讀細(xì)胞通信邏輯、狀態(tài)變遷和外界響應(yīng)機(jī)制的核心窗口。它將基礎(chǔ)研究與轉(zhuǎn)化應(yīng)用有效聯(lián)通，為組織構(gòu)建、疾病理解和靶點(diǎn)發(fā)現(xiàn)提供了堅(jiān)實(shí)的數(shù)據(jù)支撐。百泰派克生物科技將持續(xù)關(guān)注細(xì)胞表面蛋白組學(xué)領(lǐng)域的zuì新進(jìn)展，助力生命科學(xué)研究邁向更高分辨率、更深層次的分子理解。

百泰派克生物科技特色項(xiàng)目

一、蛋白測(cè)序

百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos質(zhì)譜儀及島津公司埃德曼降解測(cè)序系統(tǒng)對(duì)dànbáizhì序列進(jìn)行分析，提供基于質(zhì)譜的蛋白測(cè)序分析服務(wù)，包括對(duì)dànbáizhì的氨基酸組成分析，Nduāncèxù，Cduāncèxù和全序列分析，以及基于埃德曼降解的dànbáizhìN端序列分析服務(wù)。對(duì)于未知理論序列的dànbáizhì，提供基于從頭測(cè)序法的dànbáizhì從頭測(cè)序服務(wù)，對(duì)蛋白序列進(jìn)行分析。

※服務(wù)優(yōu)勢(shì)：

1.采用目前世界上先進(jìn)的質(zhì)譜儀器 Obitrap Fusion Lumos;

2.可實(shí)現(xiàn)對(duì)所測(cè)定靶蛋白序列 100% 的覆蓋;

3.可測(cè)定蛋白N端多達(dá) 70個(gè)氨基酸序列;

4.可測(cè)定多種形式的樣品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白條帶;

5.樣品用量低: 蛋白樣品僅需 5-10ug，即可完成檢測(cè);

6.測(cè)序不受N端封閉，PEC和和糖基化等N端修飾的影響。

二、dànbáizhì組學(xué)

百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos質(zhì)譜平臺(tái)結(jié)合Nano-LC，提供定量dànbáizhì組學(xué)、靶向dànbáizhì組學(xué)、多肽組學(xué)、翻譯后修飾蛋白組學(xué)等多種dànbáizhì組學(xué)分析服務(wù)。此外，百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4Ddànbáizhì組學(xué)服務(wù)，助力微量樣本蛋白組學(xué)、大樣本群醫(yī)學(xué)及高通量修飾組學(xué)等研究工作。

※服務(wù)優(yōu)勢(shì)：

1 .高通量定量蛋白分析:多對(duì)照組大規(guī)模實(shí)驗(yàn)分析，發(fā)現(xiàn)新的生物標(biāo)記物;

2.體內(nèi)體外多種dànbáizhì標(biāo)記方法，適用于分析組織、細(xì)胞、血液等多種樣品;

3.質(zhì)譜分析靈敏度高，實(shí)驗(yàn)結(jié)果重復(fù)度高;

4.可檢測(cè)較低豐度蛋白，線性范圍廣;

5.zhuānyè生物信息學(xué)分析，分析更系統(tǒng)準(zhǔn)確。

三、單細(xì)胞質(zhì)譜流式技術(shù)分析

百泰派克生物科技采用Fluidigm質(zhì)譜流式系統(tǒng)進(jìn)行單細(xì)胞質(zhì)譜流式技術(shù)分析，采用金屬元素標(biāo)記物（通常是金屬元素標(biāo)記的特異抗體）標(biāo)記細(xì)胞表面和內(nèi)部的分子，然后用流式細(xì)胞原理分離單個(gè)細(xì)胞，再用電感耦合等離子體質(zhì)譜（ICP-MS）分析單個(gè)細(xì)胞的原子質(zhì)量譜，zuì后將原子質(zhì)量譜數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換為細(xì)胞表面和內(nèi)部的信號(hào)分子表達(dá)量。

※服務(wù)優(yōu)勢(shì)：

1.技術(shù)先進(jìn)，填補(bǔ)技術(shù)空白

采用金屬標(biāo)記抗體技術(shù)，避免了傳統(tǒng)流式熒光通道少且易相互影響的問(wèn)題。可在單細(xì)胞層面上對(duì)多種指標(biāo)同時(shí)進(jìn)行表征，百泰派克生物科技可做到同時(shí)檢測(cè)51個(gè)目標(biāo)蛋白。

2.分析數(shù)量大，成本較低

單細(xì)胞RNAseq受成本等因素限制，所有樣本細(xì)胞匯總的分析數(shù)目一般在2x10^4個(gè)左右，而流式質(zhì)譜技術(shù)一次（單樣本）就可分析至少10^5的細(xì)胞，實(shí)現(xiàn)了數(shù)量級(jí)的提高，且成本不高于單細(xì)胞RNAseq。

3.應(yīng)用前景大

①流式質(zhì)譜結(jié)果可以給出細(xì)胞亞群的變化，在臨床診斷、疾病機(jī)制研究等方面具有極大的研究前景；

②將金屬標(biāo)簽技術(shù)與其他技術(shù)結(jié)合會(huì)有新應(yīng)用方向。除常規(guī)蛋白外，質(zhì)譜流式細(xì)胞技術(shù)還可用于蛋白翻譯后修飾；

③可檢測(cè)細(xì)胞存活率、細(xì)胞大小、mRNA轉(zhuǎn)錄子表達(dá)量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。

四、基于高精度質(zhì)譜的免疫多肽組學(xué)分析及新抗原發(fā)現(xiàn)

百泰派克生物科技的基于高精度質(zhì)譜的免疫多肽組學(xué)分析及新抗原發(fā)現(xiàn)一站式解決方案包括我們專有的、高度敏感的免疫肽富集和鑒定方案。我們能夠幫助您實(shí)現(xiàn)10,000個(gè)以上I型多肽和10,000個(gè)以上II型多肽的鑒定和識(shí)別。通過(guò)我們優(yōu)化的高通量免疫多肽組學(xué)分析平臺(tái)進(jìn)行免疫肽組學(xué)分析，可從zuì小的樣品材料中進(jìn)行可重復(fù)的識(shí)別和定量。該服務(wù)可以應(yīng)用于大規(guī)模的研究，旨在助力科研工作者尋找癌癥、免疫疾病及傳染病的解決方案，深入挖掘未知的靶標(biāo)。

五、生物藥物表征

百泰派克基于高分辨率質(zhì)譜技術(shù)，MALDI TOF，高效色譜分離技術(shù)，提供一系列完善的生物藥物分析方案，從dànbáizhì、多肽、抗體、疫苗等生物制品的氨基酸組成和一級(jí)結(jié)構(gòu)分析，到產(chǎn)品變異性和純度分析。旨在提供優(yōu)質(zhì)生物藥物分析服務(wù)，幫助生物醫(yī)藥生產(chǎn)商提高生物藥物品質(zhì)。

百泰派克生物科技七大檢測(cè)平臺(tái)

百泰派克生物科技-生物制品表征，生物質(zhì)譜多組學(xué)優(yōu)質(zhì)服務(wù)商

北京百泰派克生物科技有限公司致力于為生物/制藥和醫(yī)療器械行業(yè)提供質(zhì)量控制檢測(cè)和項(xiàng)目驗(yàn)證等zhuānyè服務(wù)。公司實(shí)驗(yàn)室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法規(guī)和指導(dǎo)原則，通過(guò)CNAS/ISO9001雙重質(zhì)量體系認(rèn)證，建立了完備的質(zhì)量體系，數(shù)據(jù)冷熱/異地備份，設(shè)備定期計(jì)量/期間核查，軟件審計(jì)追蹤，為客戶提供一體化解決方案和技術(shù)服務(wù)，支持新藥研發(fā)、藥物申報(bào)注冊(cè)和生產(chǎn)放行。

1.公司采用ISO9001質(zhì)量控制體系，zhuānyè提供以質(zhì)譜為基礎(chǔ)的CRO檢測(cè)分析服務(wù)；

2.獲國(guó)家CNAS實(shí)驗(yàn)室認(rèn)可，為客戶提供符合全球藥政法規(guī)的藥物質(zhì)量研究服務(wù)；

3.業(yè)務(wù)范圍覆蓋dànbáizhì組學(xué)、多肽組學(xué)、代謝組學(xué)、生物藥物表征、單細(xì)胞分析、單細(xì)胞質(zhì)譜流式、生信云分析以及多組學(xué)生物質(zhì)譜整合分析等；

4.七大質(zhì)量控制檢測(cè)平臺(tái)，滿足您一站式服務(wù)需求；

5.服務(wù)3000+企業(yè)，10000+客戶的選擇；

6.致力于為您提供優(yōu)質(zhì)的生物質(zhì)譜分析服務(wù)!

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