蛋白從頭測(cè)序和突變分析檢測(cè)技術(shù)服務(wù)詳情介紹

蛋白分子在試劑盒研發(fā)、診斷試劑開(kāi)發(fā)和藥物研發(fā)中扮演了關(guān)鍵的角色。蛋白分子本身的一級(jí)結(jié)構(gòu)是發(fā)揮其生物學(xué)功能的核心，因此，對(duì)蛋白質(zhì)完整序列準(zhǔn)確快速的分析有助于未知蛋白質(zhì)的功能研究，并且對(duì)包括在內(nèi)的蛋白類(lèi)藥物研發(fā)生產(chǎn)具有十分重要的意義。傳統(tǒng)的蛋白序列分析技術(shù)，無(wú)論是基于MALDI-TOF質(zhì)譜儀還是基于nanoLC-MS/MS平臺(tái)，在蛋白鑒定過(guò)程中都需要借助包含被鑒定蛋白在內(nèi)的序列數(shù)據(jù)庫(kù)，再將質(zhì)譜測(cè)定的分子量數(shù)據(jù)與數(shù)據(jù)庫(kù)理論序列碎裂之后得到的分子量數(shù)據(jù)進(jìn)行比對(duì)，以實(shí)現(xiàn)對(duì)蛋白質(zhì)的測(cè)序和鑒定。 在實(shí)際的蛋白序列分析過(guò)程中有許多蛋白質(zhì)的信息是不包含在現(xiàn)有數(shù)據(jù)庫(kù)中的，比如一個(gè)未被報(bào)道過(guò)的全新蛋白，或者從一個(gè)全新物種中純化出來(lái)的蛋白。還有很多情況下，我們能夠得到部分的理論數(shù)據(jù)，但是缺失的那一部分才是關(guān)鍵，比如市場(chǎng)上經(jīng)過(guò)商業(yè)改造的酶，酶的序列改造信息對(duì)于打算進(jìn)行逆向工程的競(jìng)爭(zhēng)對(duì)手來(lái)說(shuō)是技術(shù)壁壘，因?yàn)樾蛄凶兓嵌喾N多樣的（點(diǎn)突變、缺失、插入、替換、修飾、融合等），這樣就存在著成千上萬(wàn)種可能性，而且通常又沒(méi)有任何方向線索可尋；不僅是試劑盒中的某個(gè)酶，許多蛋白藥物同樣需要通過(guò)突變進(jìn)行優(yōu)化以增加產(chǎn)量或者穩(wěn)定性；還有很多情況下蛋白序列產(chǎn)生了某些突變，即便是在一個(gè)藥物中發(fā)生了很少的序列突變也可能會(huì)造成生物活性的改變和產(chǎn)生人體免疫反應(yīng)，進(jìn)而造成巨大商業(yè)損失。由上述對(duì)未知蛋白質(zhì)序列和突變分析的需求出發(fā)，百泰派克公司基于高分辨率質(zhì)譜儀Obitrap Fusion Lumos，結(jié)合豐富的生物信息學(xué)分析經(jīng)驗(yàn)，建立了全新一代蛋白從頭測(cè)序和突變分析（De Novo Sequencing）平臺(tái)，實(shí)現(xiàn)對(duì)蛋白一級(jí)結(jié)構(gòu)快速準(zhǔn)確的分析。單克隆抗體

蛋白從頭測(cè)序和突變分析流程

平臺(tái)優(yōu)勢(shì)：

1. 蛋白全序列覆蓋（100% Sequence Coverage） 在蛋白質(zhì)序列測(cè)定過(guò)程中我們會(huì)選擇5種不同的蛋白酶進(jìn)行酶切，利用不同酶切肽段之間的互補(bǔ)性實(shí)現(xiàn)蛋白分子100%全序列的拼接。

2. 優(yōu)良的數(shù)據(jù)處理算法 我們基于發(fā)表在Nature Biotechnology和zhuānyè的蛋白組學(xué)雜志JPR上的文獻(xiàn)，結(jié)合現(xiàn)有的zhuānyè進(jìn)行數(shù)據(jù)庫(kù)非依賴性的蛋白序列分析的軟件PEAKS Mass Spectrometry Software，開(kāi)發(fā)了自己的質(zhì)譜原始數(shù)據(jù)計(jì)算方法，采用寬進(jìn)窄出的原則，在不遺漏任何有效數(shù)據(jù)信息的同時(shí)實(shí)現(xiàn)了蛋白序列的準(zhǔn)確鑒定。

3. 高精度和準(zhǔn)確性

我們?cè)跍y(cè)序過(guò)程中會(huì)使用高分辨率和高靈敏度的Orbitrap Fusion Lumos質(zhì)譜儀；與老一代的質(zhì)譜儀（例如Obitrap Elite、Q Exactive等）相比，Lumos在提高了一級(jí)二級(jí)質(zhì)譜掃描速度的同時(shí)保證肽段分子量的準(zhǔn)確性；一級(jí)質(zhì)譜掃描速度的提高，有助于同一個(gè)肽段可以更多次的被鑒定到，提高了結(jié)果的可信性；二級(jí)質(zhì)譜掃描速度的提高可以更好的進(jìn)行片段碎裂（如下圖所示），從而保證結(jié)果的準(zhǔn)確性，并可以通過(guò)二級(jí)碎裂片段的特征峰實(shí)現(xiàn)liàngānsuān和異liàngānsuān的準(zhǔn)確判定。

4.嚴(yán)謹(jǐn)?shù)男蛄蓄A(yù)測(cè)和嚴(yán)格的序列驗(yàn)證 我們對(duì)測(cè)序的結(jié)果會(huì)首優(yōu)良行序列的預(yù)測(cè)，同時(shí)，我們還會(huì)以測(cè)定的序列建立新的數(shù)據(jù)庫(kù)，采用Sequence Confirmation的模式對(duì)采集到的質(zhì)譜數(shù)據(jù)再次進(jìn)行分析，只有wánquán匹配的結(jié)果我們才會(huì)提供給客戶。

應(yīng)用領(lǐng)域

• 在學(xué)術(shù)研究中根據(jù)研究論文發(fā)表需要，jīngzhǔn測(cè)定未知蛋白或者肽段的序列信息；

• jīngzhǔn測(cè)定經(jīng)過(guò)商業(yè)化改造的蛋白質(zhì)和酶的序列。許多商業(yè)價(jià)值高的蛋白質(zhì)（絕大多數(shù)是酶）的氨基酸序列經(jīng)過(guò)特定改造，使蛋白質(zhì)產(chǎn)品比天然蛋白質(zhì)具有更好的特性。由于這些序列改變的蛋白質(zhì)的確切基因序列或氨基酸序列往往是非公開(kāi)的，而這些蛋白質(zhì)產(chǎn)品卻是容易得到，所以準(zhǔn)確測(cè)定這類(lèi)蛋白質(zhì)產(chǎn)品的序列有很大的商業(yè)價(jià)值；

• jīngzhǔn測(cè)定穩(wěn)定細(xì)胞系表達(dá)蛋白的序列。在細(xì)胞系的構(gòu)建和儲(chǔ)藏中容易發(fā)生突變（也稱為序列差異，sequence variant (SV)，并且有時(shí)在一個(gè)產(chǎn)品中含量很少的SV也可能會(huì)造成生物活性的改變和產(chǎn)生人體免疫反應(yīng)，進(jìn)而造成巨大潛在風(fēng)險(xiǎn)。所以，在大規(guī)模生產(chǎn)之前檢測(cè)出這種天然的突變及其重要。我們開(kāi)發(fā)的方法可以檢測(cè)低至1個(gè)氨基酸的序列差異，而且檢測(cè)范圍可以覆蓋整個(gè)蛋白/抗體序列。

中/英文項(xiàng)目報(bào)告

在技術(shù)報(bào)告中，百泰派克會(huì)為您提供詳細(xì)的中英文雙語(yǔ)版技術(shù)報(bào)告，報(bào)告包括： 1. 實(shí)驗(yàn)步驟（中英文） 2. 相關(guān)的質(zhì)譜參數(shù)（中英文） 3. 質(zhì)譜圖片 4. 原始數(shù)據(jù) 5. 肽段序列信息 6. 蛋白質(zhì)序列與突變信息

百泰派克生物科技特色項(xiàng)目

一、蛋白測(cè)序

百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos質(zhì)譜儀及島津公司埃德曼降解測(cè)序系統(tǒng)對(duì)蛋白質(zhì)序列進(jìn)行分析，提供基于質(zhì)譜的蛋白測(cè)序分析服務(wù)，包括對(duì)蛋白質(zhì)的氨基酸組成分析，N端測(cè)序，C端測(cè)序和全序列分析，以及基于埃德曼降解的蛋白質(zhì)N端序列分析服務(wù)。對(duì)于未知理論序列的蛋白質(zhì)，提供基于從頭測(cè)序法的蛋白質(zhì)從頭測(cè)序服務(wù)，對(duì)蛋白序列進(jìn)行分析。

※服務(wù)優(yōu)勢(shì)：

1.采用目前世界上優(yōu)良的質(zhì)譜儀器 Obitrap Fusion Lumos;

2.可實(shí)現(xiàn)對(duì)所測(cè)定靶蛋白序列 100% 的覆蓋;

3.可測(cè)定蛋白N端多達(dá) 70個(gè)氨基酸序列;

4.可測(cè)定多種形式的樣品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白條帶;

5.樣品用量低: 蛋白樣品僅需 5-10ug，即可完成檢測(cè);

6.測(cè)序不受N端封閉，PEC和和糖基化等N端修飾的影響。

二、蛋白質(zhì)組學(xué)

百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos質(zhì)譜平臺(tái)結(jié)合Nano-LC，提供定量蛋白質(zhì)組學(xué)、靶向蛋白質(zhì)組學(xué)、多肽組學(xué)、翻譯后修飾蛋白組學(xué)等多種蛋白質(zhì)組學(xué)分析服務(wù)。此外，百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4D蛋白質(zhì)組學(xué)服務(wù)，助力微量樣本蛋白組學(xué)、大樣本群醫(yī)學(xué)及高通量修飾組學(xué)等研究工作。

※服務(wù)優(yōu)勢(shì)：

1 .高通量定量蛋白分析:多對(duì)照組大規(guī)模實(shí)驗(yàn)分析，發(fā)現(xiàn)新的生物標(biāo)記物;

2.體內(nèi)體外多種蛋白質(zhì)標(biāo)記方法，適用于分析組織、細(xì)胞、血液等多種樣品;

3.質(zhì)譜分析靈敏度高，實(shí)驗(yàn)結(jié)果重復(fù)度高;

4.可檢測(cè)較低豐度蛋白，線性范圍廣;

5.zhuānyè生物信息學(xué)分析，分析更系統(tǒng)準(zhǔn)確。

三、單細(xì)胞質(zhì)譜流式技術(shù)分析

百泰派克生物科技采用Fluidigm質(zhì)譜流式系統(tǒng)進(jìn)行單細(xì)胞質(zhì)譜流式技術(shù)分析，采用金屬元素標(biāo)記物（通常是金屬元素標(biāo)記的特異抗體）標(biāo)記細(xì)胞表面和內(nèi)部的分子，然后用流式細(xì)胞原理分離單個(gè)細(xì)胞，再用電感耦合等離子體質(zhì)譜（ICP-MS）分析單個(gè)細(xì)胞的原子質(zhì)量譜，zuì后將原子質(zhì)量譜數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換為細(xì)胞表面和內(nèi)部的信號(hào)分子表達(dá)量。

※服務(wù)優(yōu)勢(shì)：

1.技術(shù)優(yōu)良，*技術(shù)空白

采用金屬標(biāo)記抗體技術(shù)，避免了傳統(tǒng)流式熒光通道少且易相互影響的問(wèn)題?？稍趩渭?xì)胞層面上對(duì)多種指標(biāo)同時(shí)進(jìn)行表征，百泰派克生物科技可做到同時(shí)檢測(cè)51個(gè)目標(biāo)蛋白。

2.分析數(shù)量大，成本較低

單細(xì)胞RNAseq受成本等因素限制，所有樣本細(xì)胞匯總的分析數(shù)目一般在2x10^4個(gè)左右，而流式質(zhì)譜技術(shù)一次（單樣本）就可分析至少10^5的細(xì)胞，實(shí)現(xiàn)了數(shù)量級(jí)的提高，且成本不高于單細(xì)胞RNAseq。

3.應(yīng)用前景大

①流式質(zhì)譜結(jié)果可以給出細(xì)胞亞群的變化，在臨床診斷、疾病機(jī)制研究等方面具有極大的研究前景；

②將金屬標(biāo)簽技術(shù)與其他技術(shù)結(jié)合會(huì)有新應(yīng)用方向。除常規(guī)蛋白外，質(zhì)譜流式細(xì)胞技術(shù)還可用于蛋白翻譯后修飾；

③可檢測(cè)細(xì)胞存活率、細(xì)胞大小、mRNA轉(zhuǎn)錄子表達(dá)量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。

四、基于高精度質(zhì)譜的免疫多肽組學(xué)分析及新抗原發(fā)現(xiàn)

百泰派克生物科技的基于高精度質(zhì)譜的免疫多肽組學(xué)分析及新抗原發(fā)現(xiàn)一站式解決方案包括我們專(zhuān)有的、高度敏感的免疫肽富集和鑒定方案。我們能夠幫助您實(shí)現(xiàn)10,000個(gè)以上I型多肽和10,000個(gè)以上II型多肽的鑒定和識(shí)別。通過(guò)我們優(yōu)化的高通量免疫多肽組學(xué)分析平臺(tái)進(jìn)行免疫肽組學(xué)分析，可從zuì小的樣品材料中進(jìn)行可重復(fù)的識(shí)別和定量。該服務(wù)可以應(yīng)用于大規(guī)模的研究，旨在助力科研工作者尋找癌癥、免疫疾病及傳染病的解決方案，深入挖掘未知的靶標(biāo)。

五、生物藥物表征

百泰派克基于高分辨率質(zhì)譜技術(shù)，MALDI TOF，高效色譜分離技術(shù)，提供一系列完善的生物藥物分析方案，從蛋白質(zhì)、多肽、抗體、疫苗等生物制品的氨基酸組成和一級(jí)結(jié)構(gòu)分析，到產(chǎn)品變異性和純度分析。旨在提供優(yōu)質(zhì)生物藥物分析服務(wù)，幫助生物醫(yī)藥生產(chǎn)商提高生物藥物品質(zhì)。

百泰派克生物科技七大檢測(cè)平臺(tái)

百泰派克生物科技-生物制品表征，生物質(zhì)譜多組學(xué)優(yōu)質(zhì)服務(wù)商

北京百泰派克生物科技有限公司致力于為生物/制藥和醫(yī)療器械行業(yè)提供質(zhì)量控制檢測(cè)和項(xiàng)目驗(yàn)證等zhuānyè服務(wù)。公司實(shí)驗(yàn)室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法規(guī)和指導(dǎo)原則，通過(guò)CNAS/ISO9001雙重質(zhì)量體系認(rèn)證，建立了完備的質(zhì)量體系，數(shù)據(jù)冷熱/異地備份，設(shè)備定期計(jì)量/期間核查，軟件審計(jì)追蹤，為客戶提供一體化解決方案和技術(shù)服務(wù)，支持新藥研發(fā)、藥物申報(bào)注冊(cè)和生產(chǎn)放行。

1.公司采用ISO9001質(zhì)量控制體系，zhuānyè提供以質(zhì)譜為基礎(chǔ)的CRO檢測(cè)分析服務(wù)；

2.獲國(guó)家CNAS實(shí)驗(yàn)室認(rèn)可，為客戶提供符合全球藥政法規(guī)的藥物質(zhì)量研究服務(wù)；

3.業(yè)務(wù)范圍覆蓋蛋白質(zhì)組學(xué)、多肽組學(xué)、代謝組學(xué)、生物藥物表征、單細(xì)胞分析、單細(xì)胞質(zhì)譜流式、生信云分析以及多組學(xué)生物質(zhì)譜整合分析等；

4.七大質(zhì)量控制檢測(cè)平臺(tái)，滿足您一站式服務(wù)需求；

5.服務(wù)3000+企業(yè)，10000+客戶的選擇；

6.致力于為您提供優(yōu)質(zhì)的生物質(zhì)譜分析服務(wù)!

蛋白從頭測(cè)序和突變分析檢測(cè)技術(shù)服務(wù)詳情介紹