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北京百泰派克生物科技有限公司
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Peaks軟件在蛋白從頭測(cè)序中的應(yīng)用

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品       牌百泰派克

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更新時(shí)間:2025-05-03 09:03:57瀏覽次數(shù):53次

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Peaks軟件在蛋白從頭測(cè)序中的應(yīng)用檢測(cè)技術(shù)服務(wù): 基于Peaks軟件的從頭測(cè)序是一種不依賴已知蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫(kù),直接從質(zhì)譜數(shù)據(jù)推導(dǎo)蛋白質(zhì)或肽段氨基酸序列的計(jì)算方法。在蛋白質(zhì)組學(xué)研究中,傳統(tǒng)的蛋白質(zhì)鑒定方法通常依賴數(shù)據(jù)庫(kù)匹配,即將實(shí)驗(yàn)獲得的肽段質(zhì)譜數(shù)據(jù)與已知蛋白數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行比對(duì)。但是這種方法在研究非模式生物、新蛋白、抗體測(cè)序或突變蛋白時(shí)存在局限性,因?yàn)閿?shù)據(jù)庫(kù)可能無(wú)法覆蓋所有可能的蛋白序列。而基于Peak

Peaks軟件在蛋白從頭測(cè)序中的應(yīng)用檢測(cè)技術(shù)服務(wù)詳情介紹

基于Peaks軟件的從頭測(cè)序是一種不依賴已知蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫(kù),直接從質(zhì)譜數(shù)據(jù)推導(dǎo)蛋白質(zhì)或肽段氨基酸序列的計(jì)算方法。在蛋白質(zhì)組學(xué)研究中,傳統(tǒng)的蛋白質(zhì)鑒定方法通常依賴數(shù)據(jù)庫(kù)匹配,即將實(shí)驗(yàn)獲得的肽段質(zhì)譜數(shù)據(jù)與已知蛋白數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行比對(duì)。但是這種方法在研究非模式生物、新蛋白、抗體測(cè)序或突變蛋白時(shí)存在局限性,因?yàn)閿?shù)據(jù)庫(kù)可能無(wú)法覆蓋所有可能的蛋白序列。而基于Peaks軟件的從頭測(cè)序能夠直接從高分辨率質(zhì)譜數(shù)據(jù)中解析氨基酸序列,為未知蛋白研究提供高效、jīngzhǔn的解決方案。在生物制藥、抗體工程、翻譯后修飾分析、蛋白質(zhì)突變研究等領(lǐng)域,基于Peaks軟件的從頭測(cè)序具有廣泛的應(yīng)用價(jià)值。例如,在抗體藥物開(kāi)發(fā)過(guò)程中,抗體可變區(qū)的序列信息至關(guān)重要,而從頭測(cè)序技術(shù)能夠解析重鏈和輕鏈的完整序列,確??贵w的正確表達(dá)和功能。此外,在生物醫(yī)學(xué)研究中,許多疾病相關(guān)的蛋白可能具有未知的翻譯后修飾或突變,從頭測(cè)序能夠提供jīngzhǔn的序列信息,揭示其潛在的生物學(xué)意義。在食品科學(xué)、工業(yè)酶工程、病原體鑒定等領(lǐng)域,該技術(shù)同樣發(fā)揮作用,使得未知蛋白或肽段的鑒定更加便捷可靠。


Peaks軟件在蛋白從頭測(cè)序中的應(yīng)用的核心原理是利用高分辨率串聯(lián)質(zhì)譜(MS/MS)數(shù)據(jù),通過(guò)智能算法解析肽段的氨基酸序列。在質(zhì)譜分析過(guò)程中,蛋白質(zhì)樣本通常經(jīng)過(guò)酶解(如yídànbáiméi、Glu-C、Lys-C等)生成肽段,并通過(guò)液相色譜-質(zhì)譜聯(lián)用技術(shù)(LC-MS/MS)獲取肽段的碎片離子信息。從頭測(cè)序的關(guān)鍵步驟包括高質(zhì)量數(shù)據(jù)預(yù)處理、離子匹配和序列推導(dǎo)、錯(cuò)誤修正與置信度評(píng)分,以及多肽拼接與整合。其中,Peaks軟件通過(guò)先進(jìn)的算法提高序列解析的準(zhǔn)確性和覆蓋度,確保研究人員能夠獲得完整、準(zhǔn)確的氨基酸序列信息。


相比于傳統(tǒng)數(shù)據(jù)庫(kù)搜索方法,Peaks軟件在蛋白從頭測(cè)序中的應(yīng)用具有顯著優(yōu)勢(shì)。首先,該方法無(wú)需數(shù)據(jù)庫(kù)匹配,適用于研究新蛋白、非模式生物和抗體序列解析,突破了數(shù)據(jù)庫(kù)搜索的局限性。其次其高準(zhǔn)確性依托先進(jìn)算法和高分辨率質(zhì)譜數(shù)據(jù),提高了序列解析的置信度,減少錯(cuò)誤匹配。此外,該方法覆蓋全面,不僅能夠解析氨基酸序列,還可提供翻譯后修飾、突變分析等信息,使得研究更加深入。該方法適用于復(fù)雜樣本,能夠處理混合蛋白樣本、修飾蛋白和低豐度蛋白,廣泛應(yīng)用于蛋白質(zhì)組學(xué)和生物醫(yī)藥研究。


百泰派克生物科技憑借多年蛋白質(zhì)組學(xué)研究經(jīng)驗(yàn),提供高精度的從頭測(cè)序服務(wù)。我們的zhuānyè團(tuán)隊(duì)結(jié)合先進(jìn)的質(zhì)譜分析技術(shù)能夠jīngquè解析蛋白質(zhì)的氨基酸序列,確保數(shù)據(jù)的可靠性和可重復(fù)性。


百泰派克生物科技特色項(xiàng)目


一、蛋白測(cè)序

百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos質(zhì)譜儀及島津公司埃德曼降解測(cè)序系統(tǒng)對(duì)蛋白質(zhì)序列進(jìn)行分析,提供基于質(zhì)譜的蛋白測(cè)序分析服務(wù),包括對(duì)蛋白質(zhì)的氨基酸組成分析,N端測(cè)序,C端測(cè)序和全序列分析,以及基于埃德曼降解的蛋白質(zhì)N端序列分析服務(wù)。對(duì)于未知理論序列的蛋白質(zhì),提供基于從頭測(cè)序法的蛋白質(zhì)從頭測(cè)序服務(wù),對(duì)蛋白序列進(jìn)行分析。


※服務(wù)優(yōu)勢(shì):

1.采用目前世界上先進(jìn)的質(zhì)譜儀器 Obitrap Fusion Lumos;

2.可實(shí)現(xiàn)對(duì)所測(cè)定靶蛋白序列 100% 的覆蓋;

3.可測(cè)定蛋白N端多達(dá) 70個(gè)氨基酸序列;

4.可測(cè)定多種形式的樣品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白條帶;

5.樣品用量低: 蛋白樣品僅需 5-10ug,即可完成檢測(cè);

6.測(cè)序不受N端封閉,PEC和和糖基化等N端修飾的影響。



二、蛋白質(zhì)組學(xué)

百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos質(zhì)譜平臺(tái)結(jié)合Nano-LC,提供定量蛋白質(zhì)組學(xué)、靶向蛋白質(zhì)組學(xué)、多肽組學(xué)、翻譯后修飾蛋白組學(xué)等多種蛋白質(zhì)組學(xué)分析服務(wù)。此外,百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4D蛋白質(zhì)組學(xué)服務(wù),助力微量樣本蛋白組學(xué)、大樣本群醫(yī)學(xué)及高通量修飾組學(xué)等研究工作。


※服務(wù)優(yōu)勢(shì):

1 .高通量定量蛋白分析:多對(duì)照組大規(guī)模實(shí)驗(yàn)分析,發(fā)現(xiàn)新的生物標(biāo)記物;

2.體內(nèi)體外多種蛋白質(zhì)標(biāo)記方法,適用于分析組織、細(xì)胞、血液等多種樣品;

3.質(zhì)譜分析靈敏度高,實(shí)驗(yàn)結(jié)果重復(fù)度高;

4.可檢測(cè)較低豐度蛋白,線性范圍廣;

5.zhuānyè生物信息學(xué)分析,分析更系統(tǒng)準(zhǔn)確。



三、單細(xì)胞質(zhì)譜流式技術(shù)分析

百泰派克生物科技采用Fluidigm質(zhì)譜流式系統(tǒng)進(jìn)行單細(xì)胞質(zhì)譜流式技術(shù)分析,采用金屬元素標(biāo)記物(通常是金屬元素標(biāo)記的特異抗體)標(biāo)記細(xì)胞表面和內(nèi)部的分子,然后用流式細(xì)胞原理分離單個(gè)細(xì)胞,再用電感耦合等離子體質(zhì)譜(ICP-MS)分析單個(gè)細(xì)胞的原子質(zhì)量譜,zuì后將原子質(zhì)量譜數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換為細(xì)胞表面和內(nèi)部的信號(hào)分子表達(dá)量。


※服務(wù)優(yōu)勢(shì):

1.技術(shù)先進(jìn),填補(bǔ)技術(shù)空白

采用金屬標(biāo)記抗體技術(shù),避免了傳統(tǒng)流式熒光通道少且易相互影響的問(wèn)題??稍趩渭?xì)胞層面上對(duì)多種指標(biāo)同時(shí)進(jìn)行表征,百泰派克生物科技可做到同時(shí)檢測(cè)51個(gè)目標(biāo)蛋白。

2.分析數(shù)量大,成本較低

單細(xì)胞RNAseq受成本等因素限制,所有樣本細(xì)胞匯總的分析數(shù)目一般在2x10^4個(gè)左右,而流式質(zhì)譜技術(shù)一次(單樣本)就可分析至少10^5的細(xì)胞,實(shí)現(xiàn)了數(shù)量級(jí)的提高,且成本不高于單細(xì)胞RNAseq。

3.應(yīng)用前景大

①流式質(zhì)譜結(jié)果可以給出細(xì)胞亞群的變化,在臨床診斷、疾病機(jī)制研究等方面具有極大的研究前景;

②將金屬標(biāo)簽技術(shù)與其他技術(shù)結(jié)合會(huì)有新應(yīng)用方向。除常規(guī)蛋白外,質(zhì)譜流式細(xì)胞技術(shù)還可用于蛋白翻譯后修飾;

③可檢測(cè)細(xì)胞存活率、細(xì)胞大小、mRNA轉(zhuǎn)錄子表達(dá)量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。



四、基于高精度質(zhì)譜的免疫多肽組學(xué)分析及新抗原發(fā)現(xiàn)

百泰派克生物科技的基于高精度質(zhì)譜的免疫多肽組學(xué)分析及新抗原發(fā)現(xiàn)一站式解決方案包括我們專有的、高度敏感的免疫肽富集和鑒定方案。我們能夠幫助您實(shí)現(xiàn)10,000個(gè)以上I型多肽和10,000個(gè)以上II型多肽的鑒定和識(shí)別。通過(guò)我們優(yōu)化的高通量免疫多肽組學(xué)分析平臺(tái)進(jìn)行免疫肽組學(xué)分析,可從zuì小的樣品材料中進(jìn)行可重復(fù)的識(shí)別和定量。該服務(wù)可以應(yīng)用于大規(guī)模的研究,旨在助力科研工作者尋找癌癥、免疫疾病及傳染病的解決方案,深入挖掘未知的靶標(biāo)。



五、生物藥物表征

百泰派克基于高分辨率質(zhì)譜技術(shù),MALDI TOF,高效色譜分離技術(shù),提供一系列完善的生物藥物分析方案,從蛋白質(zhì)、多肽、抗體、疫苗等生物制品的氨基酸組成和一級(jí)結(jié)構(gòu)分析,到產(chǎn)品變異性和純度分析。旨在提供優(yōu)質(zhì)生物藥物分析服務(wù),幫助生物醫(yī)藥生產(chǎn)商提高生物藥物品質(zhì)。



百泰派克生物科技七大檢測(cè)平臺(tái)

Peaks軟件在蛋白從頭測(cè)序中的應(yīng)用




百泰派克生物科技-生物制品表征,生物質(zhì)譜多組學(xué)優(yōu)質(zhì)服務(wù)商

北京百泰派克生物科技有限公司致力于為生物/制藥和醫(yī)療器械行業(yè)提供質(zhì)量控制檢測(cè)和項(xiàng)目驗(yàn)證等zhuānyè服務(wù)。公司實(shí)驗(yàn)室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法規(guī)和指導(dǎo)原則,通過(guò)CNAS/ISO9001雙重質(zhì)量體系認(rèn)證,建立了完備的質(zhì)量體系,數(shù)據(jù)冷熱/異地備份,設(shè)備定期計(jì)量/期間核查,軟件審計(jì)追蹤,為客戶提供一體化解決方案和技術(shù)服務(wù),支持新藥研發(fā)、藥物申報(bào)注冊(cè)和生產(chǎn)放行。

1.公司采用ISO9001質(zhì)量控制體系,zhuānyè提供以質(zhì)譜為基礎(chǔ)的CRO檢測(cè)分析服務(wù);

2.獲國(guó)家CNAS實(shí)驗(yàn)室認(rèn)可,為客戶提供符合全球藥政法規(guī)的藥物質(zhì)量研究服務(wù);

3.業(yè)務(wù)范圍覆蓋蛋白質(zhì)組學(xué)、多肽組學(xué)、代謝組學(xué)、生物藥物表征、單細(xì)胞分析、單細(xì)胞質(zhì)譜流式、生信云分析以及多組學(xué)生物質(zhì)譜整合分析等;

4.七大質(zhì)量控制檢測(cè)平臺(tái),滿足您一站式服務(wù)需求;

5.服務(wù)3000+企業(yè),10000+客戶的選擇;

6.致力于為您提供優(yōu)質(zhì)的生物質(zhì)譜分析服務(wù)!



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