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12次泛素化是一種dànbáizhì翻譯后修飾(Post-translational modification, PTM),它涉及將一個(gè)或多個(gè)泛素(Ubiquitin)dànbáizhì添加到底物蛋白上。泛素是一種小的調(diào)節(jié)性dànbáizhì,可以與其他dànbáizhì共價(jià)結(jié)合。泛素化可以影響dànbáizhì的降解、位置、活性以及dànbáizhì之間的相互作用。理解哪些dànbáizhì結(jié)構(gòu)可以被泛素化需要從泛素化的機(jī)制和靶點(diǎn)特性入手。
圖1
泛素化的機(jī)制
泛素激活:泛素首先通過泛素激活酶(E1)被激活,并與之形成高能硫酯鍵。
泛素結(jié)合:激活的泛素然后被轉(zhuǎn)移到泛素結(jié)合酶(E2)。
泛素連接:泛素連接酶(E3)識(shí)別特定的底物蛋白,并協(xié)助將泛素從E2轉(zhuǎn)移到底物蛋白上。
可以泛素化的dànbáizhì結(jié)構(gòu):
1.靶位點(diǎn)特異性
賴氨酸殘基(Lysine residues):泛素化zuì常見的靶位點(diǎn)是賴氨酸(Lysine,K)殘基。泛素的C末端gānānsuān與賴氨酸的側(cè)鏈氨基形成共價(jià)鍵。
其他殘基:雖然賴氨酸是zuì常見的靶點(diǎn),但泛素也可以連接到其他氨基酸殘基,如sīānsuān、sūānsuān和半guāngānsuān
2.泛素化位點(diǎn)序列:
某些dànbáizhì序列比其他序列更容易被泛素化。雖然沒有juéduì的序列特異性,但是研究顯示含有特定序列的肽段(如PXXLXQ)容易與E3泛素連接酶結(jié)合,促進(jìn)泛素化。
3.結(jié)構(gòu)的可及性:
dànbáizhì的三級(jí)結(jié)構(gòu)會(huì)影響特定賴氨酸殘基的可及性。只有當(dāng)E2泛素結(jié)合酶和E3泛素連接酶可以接觸到這些殘基時(shí),泛素化才能發(fā)生。
4.dànbáizhì的柔性和動(dòng)態(tài)性:
柔性較高的區(qū)域或者結(jié)構(gòu)上具有一定動(dòng)態(tài)性的dànbáizhì部分更容易發(fā)生泛素化,因?yàn)樗鼈兡軌蚋菀椎剡m配于E2和E3酶的活性位點(diǎn)。
5.修飾的前體狀態(tài):
dànbáizhì的其他翻譯后修飾狀態(tài),如磷酸化、乙?;龋袝r(shí)可以增加dànbáizhì被泛素化的幾率,因?yàn)樗鼈兛梢愿淖僤ànbáizhì的電荷、構(gòu)象或者與E3泛素連接酶的親和力。
泛素化可以在多種不同類型的dànbáizhì結(jié)構(gòu)上發(fā)生,但是這一過程往往偏好那些在空間結(jié)構(gòu)上可以與E2和E3酶相互作用的賴氨酸殘基。dànbáizhì的泛素化狀態(tài)和功能受到其自身結(jié)構(gòu)特征以及細(xì)胞環(huán)境中的多種因素的影響。
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