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10次"乳酸化修飾組學(xué)分析"(Lactylation Proteomics Analysis)是指對(duì)dànbáizhì乳酸化修飾的系統(tǒng)性研究。乳酸化是指dànbáizhì在某個(gè)賴氨酸殘基上與乳酸(lactate)發(fā)生反應(yīng)形成一個(gè)修飾,這是一種翻譯后修飾(post-translational modification, PTM)。近年來(lái),隨著代謝組學(xué)和蛋白組學(xué)領(lǐng)域的迅速發(fā)展,人們發(fā)現(xiàn)乳酸不僅是代謝的中間產(chǎn)物,它在細(xì)胞信號(hào)傳導(dǎo)、基因表達(dá)調(diào)控等多個(gè)層面起著重要作用,而乳酸化就是其中的一個(gè)機(jī)制。
dànbáizhì的乳酸化修飾可能影響dànbáizhì的功能、定位、相互作用以及穩(wěn)定性等。因此,系統(tǒng)地分析dànbáizhì的乳酸化修飾有助于我們理解細(xì)胞代謝狀態(tài)與dànbáizhì功能之間的關(guān)系。
進(jìn)行乳酸化修飾組學(xué)分析通常涉及以下步驟:
1.樣品準(zhǔn)備:
從生物樣品中提取dànbáizhì,并進(jìn)行消化,通常使用yídànbáiméi將dànbáizhì分解成肽段。
2.富集乳酸化修飾肽段:
因?yàn)樾揎椇蟮碾亩卧赿ànbáizhì消化物中的豐度較低,所以需要使用特定的親和層析方法來(lái)富集含有乳酸化修飾的肽段。
3.質(zhì)譜分析:
富集后的肽段通過(guò)液相色譜-質(zhì)譜聯(lián)用技術(shù)(LC-MS/MS)進(jìn)行分離和鑒定。質(zhì)譜可以提供肽段的jīngquè質(zhì)量和碎片離子的信息,從而確定乳酸化的位點(diǎn)。
4.數(shù)據(jù)分析:
質(zhì)譜數(shù)據(jù)通過(guò)生物信息學(xué)工具進(jìn)行分析,以鑒定乳酸化修飾的肽段和dànbáizhì,并對(duì)其豐度進(jìn)行定量分析。
5.生物學(xué)功能研究:
確定了乳酸化dànbáizhì和修飾位點(diǎn)后,研究人員通常需要進(jìn)行進(jìn)一步的生物學(xué)實(shí)驗(yàn)來(lái)探索這些修飾對(duì)dànbáizhì功能的影響。
乳酸化修飾組學(xué)分析是一個(gè)不斷發(fā)展的領(lǐng)域,對(duì)于理解細(xì)胞代謝與信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)之間的聯(lián)系以及相關(guān)疾病的病理生理過(guò)程有重要的意義。
圖1
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