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24次氨基酸的等電點(diǎn)(Isoelectric Point,pI)是指氨基酸分子在某一特定的pH值下,其凈電荷為零的狀態(tài)。計(jì)算氨基酸等電點(diǎn)的基本方法涉及到考慮氨基酸分子中各官能團(tuán)(例如,氨基和羧基)的pKa值(酸解離常數(shù)的負(fù)對數(shù)值),并使用這些值來找到在這些官能團(tuán)全部或部分被質(zhì)子化的pH范圍中,氨基酸分子的凈電荷為零的pH值。
圖1
1、對于無特殊官能團(tuán)的標(biāo)準(zhǔn)氨基酸:
(1)首先,查找氨基酸的羧基(-COOH)和氨基(-NH2)的pKa值。
(2)使用以下公式計(jì)算等電點(diǎn):
圖2
2、對于有一個額外官能團(tuán)的氨基酸(例如帶有額外的羧基或氨基的氨基酸):
(1)查找氨基酸的所有官能團(tuán)的pKa值。
(2)將pKa值從低到高排序。
(3)使用中間兩個pKa值來計(jì)算等電點(diǎn):
圖3
3、對于有兩個或更多額外官能團(tuán)的氨基酸:
(1)與上面類似,首先確定所有官能團(tuán)的pKa值。
(2)將pKa值從低到高排序。
(3)根據(jù)氨基酸在中性pH下的總凈電荷,選擇適當(dāng)?shù)闹虚gpKa值來計(jì)算等電點(diǎn)。
特別注意,氨基酸的pKa值可能因文獻(xiàn)或來源而異,因此使用準(zhǔn)確的pKa值是很重要的。實(shí)際上,zuì好的方法是直接查找文獻(xiàn)中給出的特定氨基酸的pI值。如果需要進(jìn)行jīngquè的計(jì)算或有特定應(yīng)用,可能還需要考慮溶液條件(如離子強(qiáng)度、溫度等)對pKa值的影響。
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