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多肽序列測定是dànbáizhì組學研究中的一個核心環(huán)節(jié),它涉及到對dànbáizhì或多肽的序列進行jīngquè的鑒定。MS-MS,也就是串聯(lián)質(zhì)譜(Tandem Mass Spectrometry),是實現(xiàn)這一目的的一種強有力的技術。本文將介紹多肽序列測定的基本原理、MS-MS技術的工作機制以及它在生物醫(yī)學研究中的應用。
一、基本原理
dànbáizhì或多肽的序列測定基于對其組成氨基酸的識別。每種dànbáizhì是由20種氨基酸以不同順序組合而成的長鏈分子,這種順序稱為dànbáizhì的序列。測定一個dànbáizhì的序列,實質(zhì)上就是要確定這些氨基酸的排列順序。
二、MS-MS技術
串聯(lián)質(zhì)譜技術通過兩級質(zhì)譜分析來實現(xiàn)多肽序列的測定。首先,在dìyī級質(zhì)譜(MS1)中,混合的dànbáizhì樣品被電離成帶電的分子(離子),然后通過質(zhì)荷比(m/z)進行分離。接著,選定特定的離子進行第二級質(zhì)譜(MS2)分析。在MS2中,這些選定的離子被進一步分解成更小的片段離子,通過分析這些片段離子的質(zhì)荷比,可以推斷出原始多肽的氨基酸序列。
三、步驟流程
樣本準備dànbáizhì提取:從生物樣本中提取dànbáizhì,并通過酶(如yídànbáiméi)切割成多肽。肽段純化:使用色譜技術(如液相色譜)純化切割后的多肽,以減少樣品復雜性并提高后續(xù)分析的靈敏度。
MS/MS分析dìyī級質(zhì)譜(MS1):多肽樣品被引入質(zhì)譜儀,并被電離(通常使用電噴霧電離,ESI,或基質(zhì)輔助激光解吸/電離,MALDI)。電離后的多肽離子在dìyī級質(zhì)譜中被測量其質(zhì)荷比(m/z)。離子選擇與碎片化:特定的多肽離子根據(jù)其m/z值被選中并送入碰撞室,在那里它們被碎片化。這個過程產(chǎn)生一系列代表原始多肽序列不同部分的碎片離子。第二級質(zhì)譜(MS2):這些碎片離子的m/z值在第二級質(zhì)譜中被測量,生成一個譜圖,即MS/MS譜圖。
圖1. 蛋白/多肽串聯(lián)質(zhì)譜測序流程
四、序列測定譜圖分析
MS/MS譜圖被分析以鑒定碎片離子的類型和順序,這些信息被用來推斷原始多肽的氨基酸序列。數(shù)據(jù)庫搜索:使用特定的軟件(如Mascot,SEQUEST,或MaxQuant)將MS/MS數(shù)據(jù)與已知dànbáizhì數(shù)據(jù)庫進行匹配,以確定多肽的序列。
MS-MS技術是一種強大的工具,對于理解生物系統(tǒng)的分子機制至關重要。通過jīngquè地鑒定dànbáizhì和多肽的序列,它幫助科學家揭示了許多生命過程的秘密,推動了生物醫(yī)學研究的發(fā)展。隨著技術的進步和應用的拓展,MS-MS將繼續(xù)在dànbáizhì組學及其相關領域中發(fā)揮重要作用。
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