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ChIP-Seq測序與分析

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廠商性質生產商

所  在  地上海市

更新時間:2024-07-18 12:31:29瀏覽次數(shù):2480次

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產地類別 國產 應用領域 醫(yī)療衛(wèi)生,生物產業(yè),農林牧漁
單位 /樣本
ChIP-Seq測序與分析 是指通過染色質免疫共沉淀技術特異性地富集目的蛋白結合的DNA片段,并對其進行純化和文庫構建;然后對富集得到的DNA片段進行高通量測序,通過將獲得的數(shù)百萬條序列標簽精確定位到基因組上,從而獲得全基因組范圍內與組蛋白、轉錄因子等互作的 DNA 區(qū)段信息,是目前在全基因組水平研究蛋白結合靶DNA序列的重要手段,為轉錄因子、組蛋白修飾、核小體定位等表觀遺傳學的研究提供有效方法。

ChIP-Seq測序與分析

ChIP-Seq測序與分析 是指通過染色質免疫共沉淀技術(ChIP)特異性地富集目的蛋白結合的DNA 片段,并對其進行純化和文庫構建;然后富集得到的DNA 片段進行高通量測序,通過將獲得的數(shù)百萬條序列標簽精確定位到基因組上,從而獲得全基因組范圍內與組蛋白、轉錄因子等互作的 DNA 區(qū)段信息,是目前在全基因組水平研究蛋白結合靶DNA序列的重要手段,為轉錄因子、組蛋白修飾、核小體定位等表觀遺傳學的研究提供有效方法。其將染色質免疫共沉淀技術(Chromatin Immunoprecipitation,ChIP)與高通量測序(Sequencing)技術相結合,是研究體內蛋白質與DNA相互作用的經典實驗方法。

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實驗流程


ChIP-seq生物信息分析流程.png

分析流程


該技術的主要優(yōu)勢:

1) 全基因組覆蓋:ChIP-seq相較于傳統(tǒng)的ChIP芯片,能夠實現(xiàn)全基因組范圍的、單堿基水平的蛋白結合位點篩選與鑒定;

2) 高靈敏度:每個樣本可獲得數(shù)百萬條的序列標簽,可發(fā)現(xiàn)研究基因組上稀有的蛋白結合位點;

3) 高精確率:可獲得高水平的信噪比數(shù)據(jù),準確區(qū)分真實事件與噪音,精確定位蛋白結合位點。


該技術在基礎研究中的應用:

1) 應用于轉錄因子結合位點的研究:ChIP-seq技術廣泛應用于與轉錄因子相關的生物學作用與相關機制的研究。分析轉錄因子在不同細胞、不同狀態(tài)下所發(fā)揮的作用;

2) 應用于組蛋白修飾的研究:ChIP-seq技術亦常應用于研究組蛋白的修飾分布,通過觀察組蛋白修飾的分布情況,進一步明確組蛋白修飾所發(fā)揮的生物學作用;

3) 應用于核小體定位研究:運用ChIP-seq技術研究核小體的分布規(guī)律,進而分析得知核小體對基因表達所產生的影響。


公司簡介

上海昆盟生物科技有限公司 (Coweldgen Scientific Co.,LTD) 是一家專注于生命科學領域提供相關試劑產品和服務的生物高科技企業(yè),坐落于上海聚科生物產業(yè)園。公司提供種類齊全的細胞系和多種原代細胞、質量穩(wěn)定的細胞培養(yǎng)試劑產品、成熟高效的技術服務。本著“守正創(chuàng)新,科學嚴謹"的理念,我們以高標準塑造行業(yè)品牌,以全新視野構建現(xiàn)代企業(yè),勇于探索和創(chuàng)新。公司業(yè)務范圍涉及全國各省市自治區(qū),與國內多家醫(yī)院、高校、科研院所、生物科技公司建立了良好的合作關系,贏得了良好的市場聲譽和廣泛的認可,我們保證將繼續(xù)為廣大科研用戶提供專業(yè)、高效、優(yōu)質的產品及服務!

細胞系(帶STR鑒定) | 原代細胞 | 細胞培養(yǎng)基 | 血清 | 細胞培養(yǎng)添加因子 | 標記細胞 | 耐藥細胞 | 生化檢測試劑盒 | WB試劑 | 抗體 等;ATAC-seq分析 | ChIP-seq分析 | 16S rRNA測序分析 | Pull down實驗 | RIP 實驗 | ChIP實驗 | Co-IP實驗 | 質譜檢測 | WB檢測 | PCR檢測 | 細胞培養(yǎng)/增殖/凋亡/周期/遷移/侵襲/自噬 | 活體成像 | 免疫組化 | 電鏡檢測 | micro-CT 檢測  等。

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