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技術(shù)文章

MS-MLPA的原理

閱讀:26          發(fā)布時(shí)間:2025-6-9

甲基化特異性MLPA (MS-MLPA) SALSA® MLPA®®技術(shù)的一種變體。通過MS-MLPA,可以同時(shí)對多個(gè)目標(biāo)進(jìn)行半定量的甲基化分析。

MS-MLPA 探針

如同常規(guī)MLPA探針混合物,MS-MLPA探針混合物包含靶向特定基因組序列的探針。每個(gè)探針由兩部分組成:左探針寡核苷酸(LPO)和右探針寡核苷酸(RPO)。MS-MLPA探針混合物中的某些探針靶向包含甲基化敏感性HhaI內(nèi)切酶限制位點(diǎn)的區(qū)域。這些探針可用于甲基化分析。

MS-MLPA的原理

探針與樣品DNA上的目標(biāo)序列雜交。然后使用HhaI酶消化未甲基化的雙鏈探針-DNA復(fù)合物。

與未甲基化樣本DNA形成的復(fù)合物會被消化。消化后的探針無法呈指數(shù)級擴(kuò)增,因此不會產(chǎn)生信號。與甲基化樣本DNA形成的復(fù)合物不會被HhaI消化,并將產(chǎn)生正常信號。

MS-MLPA 反應(yīng)

MS-MLPA 的步驟與MLPA的步驟非常相似。重要的區(qū)別是反應(yīng)在過夜雜交后被分為未消化和已消化的反應(yīng)。

未消化的反應(yīng)用于拷貝數(shù)測定。在消化反應(yīng)中,用于甲基化分析,HhaI酶與Ligase-65酶同時(shí)加入。

數(shù)據(jù)分析

Coffalyser™ 用于分析數(shù)據(jù)??截悢?shù)與常規(guī) MLPA 的方法相同,通過未消化反應(yīng)來確定。DNA 樣品中的甲基化百分比是通過將消化反應(yīng)中的每個(gè)探針信號與未消化反應(yīng)中的相應(yīng)信號進(jìn)行比較來確定的。

完成

對您的MLPA數(shù)據(jù)進(jìn)行完整分析。

質(zhì)量

對您的樣品和實(shí)驗(yàn)進(jìn)行廣泛的的質(zhì)量控制。

Coffalyser™ 免費(fèi)的、用戶友好型 MLPA 分析軟件,由 MRC Holland 開發(fā)和支持,幫助您充分利用您的數(shù)據(jù)。

高級質(zhì)量控制

一個(gè)專為MLPA設(shè)計(jì)的高級質(zhì)量檢查系統(tǒng)幫助您評估從片段分離的質(zhì)量和MLPA反應(yīng)到參考樣品的再現(xiàn)性的一切內(nèi)容。這些檢查有助于防止您基于不良數(shù)據(jù)得出結(jié)論,并提高您對結(jié)果可靠性的信心。

可視化您的數(shù)據(jù)的所有方面

Coffalyser 允許您以多種方式可視化和分析您的數(shù)據(jù)。您可以查看電泳圖、表格,或?qū)W⒂趲в锌截悢?shù)比率的圖表。對于更復(fù)雜的病例和故障排除,您可以查看中間分析步驟的結(jié)果。要討論或存儲您的結(jié)果,您可以將總結(jié)導(dǎo)出為 PDF

獲取新信息

關(guān)于我們的產(chǎn)品的新信息可以直接從Coffalyser內(nèi)部從我們的服務(wù)器獲取。這確保了您在收到新產(chǎn)品后即可開始分析。Coffalyser的更新始終是免費(fèi)的,確保您始終從新的見解中受益。

入門指南

要開始使用,請通過您的免費(fèi)賬戶生成一個(gè)免費(fèi)的許可證密鑰并下載Coffalyser。有關(guān)安裝幫助,請參閱我們的安裝手冊。有關(guān)如何開始進(jìn)行第一次分析的信息

分析證書

COA 版本 04;發(fā)布于 2021 5 28

SALSA MLPA

SALSA® MLPA® 試劑盒分析證書

目錄編號

EK1-FAM,EK1-Cy5,EK5-FAM,EK5-Cy5,EK20-FAM

產(chǎn)品名稱

SALSA   MLPA 試劑盒

規(guī)格

100、500 2000 次反應(yīng)

運(yùn)輸條件

干冰或冷卻元件

儲存條件

到貨后存放在 - 25°C - 15°C 之間

有效期

MLPA   試劑有效期:見附錄 A(在推薦條件下儲存時(shí))。本產(chǎn)品凍融次數(shù)不得超過 25

用途

本試劑盒僅用于與 SALSAMS-MLPA 探針組合結(jié)合,按(MS-MLPA 通用協(xié)議進(jìn)行(MS-MLPA 分析

質(zhì)量控制標(biāo)準(zhǔn)

- 使用專用質(zhì)量控制探針組合測試雜交速度、連接酶 - 65 活性和聚合酶活性。新舊批次之間的引物峰變異 < 20%。參考樣本群體內(nèi)和樣本群體內(nèi)的變異 < 10%(大標(biāo)準(zhǔn)差 0.10)。殘留引物 % 低于 40%。專用測試探針的探針比率在 0.8-1.2 之間。無 DNA 反應(yīng)僅顯示 64、7076 82 nt 的對照片段。
  -
通過使用與 PCR 引物具有廣泛同源性的 LPO 混合物,對 PCR 引物混合物進(jìn)行類似引物二聚體的峰形成測試。類似引物二聚體的峰低于探針峰平均高度的三倍。
  -
對連接酶緩沖液 B 進(jìn)行批次間電導(dǎo)率變異測試,變異   < 10%。
  -
使用 5 ng DNA 對引物峰變異進(jìn)行測試(不適用于連接酶緩沖液 A 和連接酶 - 65)。變異應(yīng)≤20%。
  -
穩(wěn)定性測試(在 37°C 下孵育 1 周)。新舊批次之間的引物峰變異 < 20%。參考樣本群體內(nèi)和樣本群體內(nèi)的變異 < 10%(大標(biāo)準(zhǔn)差 0.10)。殘留引物 % 低于   40%。專用測試探針的探針比率在 0.8-1.2 之間。無   DNA 反應(yīng)僅顯示 6470、76 82 nt 的對照片段。傾斜度 < 60%。

測試結(jié)果

合格

本證書是生產(chǎn)過程中的分析聲明。所有檢測均按照制造商的使用說明進(jìn)行。本 COA 是適用于所有 SALSA MLPA 試劑盒批次的通用證書。有關(guān)批次詳情,請見附錄 A

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