化工儀器網(wǎng)手機版
移動端訪問更便捷
今日焦點 Today's Focus
查看更多+-
關(guān)注水質(zhì)安全，“高品質(zhì)供水水質(zhì)分析與檢測技術(shù)線上研討會”開課在即
2025年5月7日14:00，化工儀器網(wǎng)特舉辦“高品質(zhì)[詳細]
最新產(chǎn)品 Latest productS
查看更多+
我國科學家利用結(jié)構(gòu)預(yù)測和交聯(lián)質(zhì)譜 完善冷凍電鏡的綜合表征
2022年11月28日 14:09:03
來源：化工儀器網(wǎng) 作者：宋池 點擊量：4870
近日，華中農(nóng)業(yè)大學和北京大學的研究團隊在Cell Research發(fā)表了一項研究成果，利用結(jié)構(gòu)預(yù)測和交聯(lián)質(zhì)譜獲得RNAm6A甲基轉(zhuǎn)移復(fù)合體的結(jié)構(gòu)模型，搭建了冷凍電鏡中的“缺失”結(jié)構(gòu)。
【化工儀器網(wǎng) 項目成果】近日，華中農(nóng)業(yè)大學和北京大學的研究團隊在Cell Research發(fā)表了一項研究成果，利用結(jié)構(gòu)預(yù)測和交聯(lián)質(zhì)譜獲得RNAm6A甲基轉(zhuǎn)移復(fù)合體的結(jié)構(gòu)模型，搭建了冷凍電鏡中的“缺失”結(jié)構(gòu)。
RNA是體現(xiàn)細胞生命活動的重要載體，通過轉(zhuǎn)錄和轉(zhuǎn)錄后調(diào)控的方式對遺傳信息進行解碼和重編碼，并參與到細胞的生長代謝中。RNA上有超過150種修飾，6-甲基腺嘌呤(m6A)是高等生物mRNA中含量最多的甲基化修飾形式之一，在RNA的動態(tài)調(diào)節(jié)中發(fā)揮重要作用，影響了胚胎發(fā)布、神經(jīng)元刁姐和腫瘤發(fā)生等眾多生物學過程。
mRNA的m6A修飾由m6A甲基化轉(zhuǎn)移酶復(fù)合體(MTC)催化產(chǎn)生，該復(fù)合體包含核心催化蛋白METTL3和METTL14，以及多個調(diào)節(jié)蛋白，包括WTAP、VIRMA、HAKAI、ZC3H13和RBM15等。對于這一復(fù)合體的結(jié)構(gòu)解析，有助于解釋甲基化修飾的序列選擇性、位點特異性，以及“讀寫”的時空動態(tài)性。
RNA結(jié)構(gòu)研究常用的冷凍電鏡技術(shù)觀察到的主要是WTAP和VIRMA這兩個輔助蛋白，難以觀察METTL3和METTL14核心催化酶。為解決這一問題，研究人員發(fā)展整合結(jié)構(gòu)生物學方法，將交聯(lián)質(zhì)譜和AI結(jié)構(gòu)預(yù)測等多種研究手段和冷凍電鏡聯(lián)合。
對蛋白復(fù)合體進行化學交聯(lián)，再用高分辨質(zhì)譜，就能得到相鄰氨基酸之間的距離信息。在此基礎(chǔ)上通過對接，可以獲得m6A甲基轉(zhuǎn)移酶中各個亞基及結(jié)構(gòu)單元的大致空間關(guān)系。同時研究團隊利用AlphaFold2及Colabfold，得到復(fù)合體中蛋白間的各種可能互作方式，將實驗與AI預(yù)測互相比對、迭代和優(yōu)化，最后就得到了RNAm6A甲基轉(zhuǎn)移復(fù)合體的結(jié)構(gòu)模型。
這一模型可以對冷凍電鏡中的電子密度給出更好的歸屬和解釋，而核心結(jié)構(gòu)酶的催化中心緊挨著VIRMA的一側(cè)，為后者介導(dǎo)的甲基化修飾的特異性提供了一種解釋。
m6A的失調(diào)與腫瘤等多種疾病有關(guān)，該研究是RNA m6A甲基酶復(fù)合物作用機制研究新的突破，將為腫瘤等疾病的防治提供幫助。同時該研究確立的建模計算方法也可以用于其他蛋白質(zhì)體系的研究中。
(資料來源：北京大學新聞網(wǎng))
相關(guān)閱讀 Related Reading
查看更多+-
2.85億元儀器采購大單 中國石油大學（華東）發(fā)布政府采購意向
4月至今，中國石油大學（華東）發(fā)布多個政府采購意向，其中儀器品目100多項，預(yù)算總額達2.85億元。預(yù)計采購時間為2025年5月—...2025-05-01 23:06:01 -
預(yù)算840萬 武漢大學采購液質(zhì)聯(lián)用儀等
武漢大學就“武漢大學水風光清潔能源互補運行與控制模擬交叉集成創(chuàng)新支撐中心項目-大電流有機材料合成系統(tǒng)”發(fā)布公開招標公告，預(yù)算金額為...2025-04-30 09:53:18 -
預(yù)算270萬元 中國疾控中心環(huán)境所采購實驗室設(shè)備
近日，中國疾病預(yù)防控制中心環(huán)境與健康相關(guān)產(chǎn)品安全所委托中技國際招標有限公司組織公開招標，為環(huán)境與人群健康重點實驗室平臺采購全自動生...2025-04-30 09:37:57 -
預(yù)算911萬元 蘭州新區(qū)生態(tài)環(huán)境局采購揮發(fā)性有機物監(jiān)測儀器
近日，蘭州新區(qū)生態(tài)環(huán)境局委托甘肅中鑫項目管理咨詢有限公司組織公開招標，為化工園區(qū)揮發(fā)性有機物監(jiān)管能力提升采購車載 VOCs 監(jiān)測系...2025-04-30 09:30:04 -
近日，中國水稻研究所委托浙江求是招標代理有限公司組織公開招標，采購全自動熒光顯微鏡、四極桿飛行時間質(zhì)譜儀等儀器設(shè)備，預(yù)算1332萬...2025-04-30 09:18:07
-
預(yù)算1268萬元 廣東工業(yè)大學采購納米紅外光譜儀等設(shè)備
近日，廣東工業(yè)大學委托廣東廣招招標采購有限公司組織公開招標，采購納米紅外光譜儀和液相色譜質(zhì)譜聯(lián)用儀，預(yù)算1268萬元。2025-04-29 10:16:31
版權(quán)與免責聲明
- ①凡本網(wǎng)注明“來源：化工儀器網(wǎng)”的所有作品，均為浙江興旺寶明通網(wǎng)絡(luò)有限公司-化工儀器網(wǎng)合法擁有版權(quán)或有權(quán)使用的作品，未經(jīng)本網(wǎng)授權(quán)不得轉(zhuǎn)載、摘編或利用其他方式使用上述作品。已經(jīng)本網(wǎng)授權(quán)使用作品的，應(yīng)在授權(quán)范圍內(nèi)使用，并注明“來源：化工儀器網(wǎng)”。違反上述聲明者，本網(wǎng)將追究其相關(guān)法律責任。
- ②本網(wǎng)轉(zhuǎn)載并注明自其他來源（非化工儀器網(wǎng)）的作品，目的在于傳遞更多信息，并不代表本網(wǎng)贊同其觀點和對其真實性負責，不承擔此類作品侵權(quán)行為的直接責任及連帶責任。其他媒體、網(wǎng)站或個人從本網(wǎng)轉(zhuǎn)載時，必須保留本網(wǎng)注明的作品第一來源，并自負版權(quán)等法律責任。
- ③如涉及作品內(nèi)容、版權(quán)等問題，請在作品發(fā)表之日起一周內(nèi)與本網(wǎng)聯(lián)系，否則視為放棄相關(guān)權(quán)利。
