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Illumina測序原理

來源:紅榮微再(上海)生物工程技術(shù)有限公司   2025年02月13日 09:30  


Illumina測序是一種基于邊合成邊測序(Sequencing by Synthesis,SBS)的高通量測序技術(shù),其原理主要包括以下幾個步驟:


1. 文庫制備

片段化:將待測DNA片段通過酶切、超聲波打斷等方法隨機打碎成200~800bp的片段。

末端修復(fù)與接頭連接:對隨機打斷的雙鏈DNA片段進行末端修復(fù),使其兩端平齊,并在兩端連接上特異性接頭序列。

PCR擴增:對連接了接頭的DNA片段進行PCR擴增,以增加DNA片段的數(shù)量。


2. 簇生成(Cluster Generation)

流動槽(Flow Cell)雜交:流動槽表面固定有與接頭互補的寡核苷酸片段,將文庫DNA片段與流動槽表面的寡核苷酸片段雜交。

橋式PCR擴增:通過橋式PCR擴增,將單拷貝DNA分子擴增成簇,形成數(shù)百萬個DNA簇。每個簇包含數(shù)千個相同的DNA分子,便于光學(xué)成像系統(tǒng)捕捉熒光信號。


3. 測序

邊合成邊測序:向反應(yīng)體系中加入DNA聚合酶、接頭引物和帶有熒光標記的4種dNTP。這些dNTP的3’端羥基被化學(xué)方法保護,每次只能添加一個dNTP。

熒光信號檢測:在dNTP被添加到合成鏈上后,洗脫未使用的dNTP和DNA聚合酶,加入激發(fā)熒光所需的緩沖液,用激光激發(fā)熒光信號,并由光學(xué)設(shè)備記錄熒光信號。

信號處理與循環(huán):將熒光信號轉(zhuǎn)化為堿基序列信息,然后加入化學(xué)試劑猝滅熒光信號并去除dNTP 3’端羥基保護基團,進行下一輪測序反應(yīng)。


4. 數(shù)據(jù)分析

數(shù)據(jù)處理:將測序產(chǎn)生的數(shù)百萬個reads進行處理,通過在文庫構(gòu)建過程中引入的獨·特index分離不同樣本的序列。

序列拼接與比對:將正向和反向reads配對,生成連續(xù)序列,并與參考基因組進行比對分析。

Illumina測序技術(shù)因其高通量、低成本、高準確度等優(yōu)勢,成為目前應(yīng)用最·廣泛的二代測序平臺。


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