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熒光定量pcr羅氏480使用步驟

2025-5-24  閱讀(152)

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羅氏LightCycler® 480 實(shí)時(shí)熒光定量PCR系統(tǒng)是實(shí)驗(yàn)室中常用的一款中高通量qPCR平臺(tái)。以下是其標(biāo)準(zhǔn)的使用步驟流程,適用于絕大多數(shù)使用SYBR Green或TaqMan探針進(jìn)行核酸擴(kuò)增和定量分析的場景:


羅氏LightCycler® 480 使用步驟

一、實(shí)驗(yàn)準(zhǔn)備

  1. 核酸提取

    • 提取DNA或RNA(如為RNA需進(jìn)行反轉(zhuǎn)錄獲得cDNA)

    • 評(píng)估濃度與純度(建議A260/A280介于1.8–2.0)

  2. 試劑準(zhǔn)備

    • 根據(jù)實(shí)驗(yàn)方案選擇合適的qPCR試劑(如SYBR Green I Master、Probe Master)

    • 準(zhǔn)備引物/探針工作液,確保無氣泡、低溫避光保存


二、反應(yīng)體系配置

標(biāo)準(zhǔn)反應(yīng)體系(以20 µL體積為例):

成分體積(µL)
Master Mix10
Forward Primer (10 µM)0.4
Reverse Primer (10 µM)0.4
探針/染料(如適用)0.2
模板DNA/cDNA1–2
無RNAse水補(bǔ)足至20 µL

注意:

  • 所有反應(yīng)成分應(yīng)在冰上配置;

  • 引物濃度通常在0.2–0.5 µM之間;

  • 若使用多重qPCR,請(qǐng)確保熒光通道互不干擾。


三、裝板與封板

  1. 將反應(yīng)混合液分裝至96孔或384孔反應(yīng)板中;

  2. 使用專用光學(xué)封板膜密封反應(yīng)板;

  3. 輕壓封膜并離心去除氣泡(例如2000 rpm × 30秒);

  4. 插入LightCycler® 480中指定托架位置。


四、程序設(shè)定(軟件操作)

在LightCycler® 480 Software中設(shè)置PCR程序,以下為常用的SYBR Green法設(shè)定模板:

  1. 預(yù)變性:95°C, 10 min

  2. 循環(huán)階段(40–45 cycles):

    • 變性:95°C, 10 sec

    • 退火:60°C, 20 sec(具體溫度依引物而定)

    • 延伸:72°C, 20 sec(有時(shí)與退火合并)

  3. 熔解曲線分析(如用SYBR Green)

    • 95°C, 5 sec

    • 65°C–95°C逐步升溫,每步0.5°C,采集熒光

  4. 熒光采集通道:根據(jù)染料選擇通道(如FAM通道用于SYBR或FAM-TaqMan探針)


五、運(yùn)行與監(jiān)控

  1. 確認(rèn)熱蓋溫度(一般為105°C);

  2. 啟動(dòng)程序運(yùn)行,期間可實(shí)時(shí)觀察擴(kuò)增曲線;

  3. 運(yùn)行時(shí)間約為1.5–2小時(shí)(視程序設(shè)定而定);


六、數(shù)據(jù)分析

  1. 擴(kuò)增曲線查看:確認(rèn)每孔反應(yīng)特征,是否存在拖尾、背景信號(hào);

  2. Ct值判讀:導(dǎo)出或自動(dòng)生成Ct結(jié)果表;

  3. 熔解曲線分析(SYBR Green):判斷特異性與是否出現(xiàn)非特異擴(kuò)增;

  4. 標(biāo)準(zhǔn)曲線法(如絕對(duì)定量):生成曲線并計(jì)算拷貝數(shù);

  5. 表達(dá)量分析(如相對(duì)定量):使用ΔΔCt法比較表達(dá)差異;


七、數(shù)據(jù)導(dǎo)出與保存

  • 可導(dǎo)出 .xls, .pdf, .xml 等格式結(jié)果;

  • 保存完整項(xiàng)目用于追溯和后續(xù)分析;

  • 建議同時(shí)備份至本地和實(shí)驗(yàn)室服務(wù)器。


八、儀器清潔與維護(hù)

  • 每次使用后清理反應(yīng)板托盤;

  • 定期進(jìn)行光路校準(zhǔn)與溫控驗(yàn)證;

  • 每月檢查熱蓋壓力與熒光通道響應(yīng);

  • 若長期不使用,建議進(jìn)行關(guān)機(jī)保護(hù)處理。


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