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ATAC-seq測(cè)序與分析
  • ATAC-seq測(cè)序與分析
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更新時(shí)間:2025-05-20 21:00:08

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染色質(zhì)開(kāi)放性是指真核生物染色質(zhì)和組蛋白、轉(zhuǎn)錄因子等是否結(jié)合的開(kāi)放程度,這一特性與染色質(zhì)轉(zhuǎn)錄活躍程度相關(guān),從而能夠揭示基因調(diào)控的機(jī)制。ATAC-seq測(cè)序與分析,即利用轉(zhuǎn)座酶研究染色質(zhì)可接近性的高通量測(cè)序,可以檢測(cè)染色質(zhì)開(kāi)放區(qū)域,其原理是通過(guò)轉(zhuǎn)座酶Tn5容易結(jié)合在開(kāi)放染色質(zhì)區(qū)域的特性,對(duì)Tn5酶捕獲到的DNA序列進(jìn)行測(cè)序和富集分析。

ATAC-seq測(cè)序與分析

染色質(zhì)開(kāi)放性是指真核生物染色質(zhì)和組蛋白、轉(zhuǎn)錄因子等是否結(jié)合的開(kāi)放程度,這一特性與染色質(zhì)轉(zhuǎn)錄活躍程度相關(guān),從而能夠揭示基因調(diào)控的機(jī)制。ATAC-seq測(cè)序與分析(Assay for Transposase Accessible Chromatin with high-throughput sequencing),即利用轉(zhuǎn)座酶研究染色質(zhì)可接近性的高通量測(cè)序,可以檢測(cè)染色質(zhì)開(kāi)放區(qū)域,其原理是通過(guò)轉(zhuǎn)座酶Tn5容易結(jié)合在開(kāi)放染色質(zhì)區(qū)域的特性,對(duì)Tn5酶捕獲到的DNA序列進(jìn)行測(cè)序和富集分析。

ATAC.png

實(shí)驗(yàn)原理


ATAC-seq技術(shù)流程.png

技術(shù)路線


ATAC分析內(nèi)容.png

分析內(nèi)容


技術(shù)優(yōu)勢(shì)
  • 常量樣本至少需要5萬(wàn)個(gè)細(xì)胞,微量樣本低至100個(gè)細(xì)胞(適用于稀有樣本)
  • 技術(shù)重復(fù)性好,成功率高
  • 實(shí)驗(yàn)步驟簡(jiǎn)單,周期短
  • 獲得信息量大(全基因組開(kāi)放染色質(zhì)區(qū)域)
物種經(jīng)驗(yàn)


  • 多物種:多種動(dòng)植物、模式生物和非模式生物
  • 多器官組織類(lèi)型:健康器官、疾病模型組織
  • 多樣品類(lèi)型:新鮮、凍存、固定

研究應(yīng)用

  • 染色體開(kāi)放性圖譜繪制(所有物種適用)

  • 胚胎發(fā)育表觀遺傳修飾(胚胎學(xué)發(fā)育研究)

  • 腫瘤發(fā)生表觀機(jī)制研究(腫瘤標(biāo)記及病理研究)

  • 疾病潛在標(biāo)志物的預(yù)測(cè)(病理及生物標(biāo)記)

  • 腫瘤異質(zhì)性或分型研究(腫瘤分型與微環(huán)境研究)

  • 作物表觀修飾差異研究(包括水稻、玉米、小麥等)


公司簡(jiǎn)介

上海昆盟生物科技有限公司 (Coweldgen Scientific Co,.LTD) 是一家專注于生命科學(xué)領(lǐng)域提供相關(guān)試劑產(chǎn)品和服務(wù)的生物高科技企業(yè),坐落于上海聚科生物產(chǎn)業(yè)園。公司提供種類(lèi)齊全的細(xì)胞系和多種原代細(xì)胞、質(zhì)量穩(wěn)定的細(xì)胞培養(yǎng)試劑產(chǎn)品、成熟高效的技術(shù)服務(wù)。本著“守正創(chuàng)新,科學(xué)嚴(yán)謹(jǐn)"的理念,我們以高標(biāo)準(zhǔn)塑造行業(yè)品牌,以全新視野構(gòu)建現(xiàn)代企業(yè),勇于探索和創(chuàng)新。公司業(yè)務(wù)范圍涉及全國(guó)各省市自治區(qū),與國(guó)內(nèi)多家醫(yī)院、高校、科研院所、生物科技公司建立了良好的合作關(guān)系,贏得了良好的市場(chǎng)聲譽(yù)和廣泛的認(rèn)可,我們保證將繼續(xù)為廣大科研用戶提供專業(yè)、高效、優(yōu)質(zhì)的產(chǎn)品及服務(wù)!

細(xì)胞系(帶STR鑒定) | 原代細(xì)胞 | 細(xì)胞培養(yǎng)基 | 血清 | 細(xì)胞培養(yǎng)添加因子 | 標(biāo)記細(xì)胞 | 耐藥細(xì)胞 | 生化檢測(cè)試劑盒 | WB試劑 | 抗體 等;ATAC-seq分析 | ChIP-seq分析 | 16S rRNA測(cè)序分析 | Pull down實(shí)驗(yàn) | RIP 實(shí)驗(yàn) | ChIP實(shí)驗(yàn) | Co-IP實(shí)驗(yàn) | 質(zhì)譜檢測(cè) | WB檢測(cè) | PCR檢測(cè) | 細(xì)胞培養(yǎng)/增殖/凋亡/周期/遷移/侵襲/自噬 | 活體成像 | 免疫組化 | 電鏡檢測(cè) | micro-CT 檢測(cè)  等。

更多信息,歡迎垂詢上海昆盟生物科技有限公司。

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