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技術(shù)文章

鴨型乙型肝炎病毒(DHBV)熒光定量PCR檢測(cè)試劑盒使用步驟

閱讀:332          發(fā)布時(shí)間:2019-8-7

鴨型乙型肝炎病毒(DHBV)熒光定量PCR檢測(cè)試劑盒使用步驟

一、樣品 DNA 的制備

1. 用自選方法純化樣品的 DNA,本試劑盒跟市場(chǎng)上大多數(shù)病毒 DNA 提取試劑盒兼容。

二、稀釋陽(yáng)性對(duì)照(以 10E2-10E7 這 6 個(gè) 10 倍稀釋度為例。由于標(biāo)準(zhǔn)品濃度非常高,

因此下列稀釋操作一定要在獨(dú)立的區(qū)域進(jìn)行,千萬(wàn)不能污染樣品或本試劑盒的其他成

鴨型乙型肝炎病毒(DHBV)熒光定量PCR檢測(cè)試劑盒               GE14-44200

分)。為增加產(chǎn)品穩(wěn)定性和避免擴(kuò)散傳染性病原,本產(chǎn)品不提供活體樣品做陽(yáng)性對(duì)照, 只提供可以直接使用的長(zhǎng)為 86bp 的 DNA 片段作為陽(yáng)性對(duì)照。

2. 標(biāo)記 6 個(gè)離心管,分別為 7,6,5,4,3,2。

3.用帶芯槍頭分別加入 45 μL 模板稀釋液(用帶芯槍頭,下同)。

4.在 7 號(hào)管中加入 5 μL 1×10E8 拷貝/μL 的陽(yáng)性對(duì)照,充分震蕩 1 分鐘,得 1×10E7 拷貝/μL 的陽(yáng)性對(duì)照。放冰上待用。

5.換槍頭,在 6 號(hào)管中加入 5 μL 1×10E7 拷貝/μL 的陽(yáng)性對(duì)照(上步稀釋所得),充分震蕩 1 分鐘,得 1×10E6 拷貝/μL 的陽(yáng)性對(duì)照。放冰上待用。

6.換槍頭,在 5 號(hào)管中加入 5 μL 1×10E6 拷貝/μL 的陽(yáng)性對(duì)照到 5 號(hào)管中,充分震蕩 1 分鐘,得 1×10E5 拷貝/μL 的陽(yáng)性對(duì)照。放冰上待用。

7.換槍頭,在 4 號(hào)管中加 5 μL 1×10E5 拷貝/μL 的陽(yáng)性對(duì)照到 4 號(hào)管中,得 1×10E4 拷貝/μL 的陽(yáng)性對(duì)照。放冰上待用。

8.重復(fù)上面的操作直到得到 6 個(gè)稀釋度的陽(yáng)性對(duì)照。放冰上待用。三、設(shè)置 qPCR 反應(yīng)(20 μL 體系,在樣品制備室進(jìn)行)

9.在 PCR 管中加入下列成分(待測(cè)樣品需要做三次重復(fù),下表只列出一次。樣品管

和陰性對(duì)照設(shè)置完畢后才設(shè)置陽(yáng)性對(duì)照,并且陽(yáng)性對(duì)照樣品要等所有管子蓋上蓋子儲(chǔ)存好后zui后加):

成分 樣品 陰性對(duì)照 陽(yáng)性對(duì)照(2-7 管)

2×qPCR MagicMix 10 μL 10 μL 各 10 μL

引物混合物 2 μL 2 μL 各 2 μL自備 10×ROX (見(jiàn)注) 2 μL 2 μL 各 2 μL

待測(cè)樣品 DNA 模板 6 μL 不加 不加

各 6μL(2 號(hào)樣到陽(yáng)性對(duì)照(2-7 號(hào)) 不加 不加 2 號(hào)管,3 號(hào)樣到 3

號(hào)管…)

注:僅 ABI7500、7700 和 7900 儀器需要使用ROX 作為對(duì)照,其他熒光 PCR 儀器(如 iCycler IQ、MJ Option、MJ Chromo4、MX3000、MX4000、RotorGene 3000、RotorGene 6000 和 LightCycler480)不需要使用 ROX,則用水替代。

10.蓋上蓋子后上機(jī),按下面參數(shù)進(jìn)行 PCR(具體 PCR 參數(shù)可以根據(jù)儀器不同而自行

優(yōu)化)。

過(guò)程 溫度 時(shí)間

預(yù)變性 95℃ 1 分鐘

PCR 反應(yīng) 95℃ 15 秒

 

 

(30 個(gè)循環(huán)) 60℃ 15 秒

72℃ 15 秒

11.數(shù)據(jù)采集

具體操作按所用儀器推薦的流程進(jìn)行。本產(chǎn)品中所含的熒光染料在不結(jié)合 DNA 時(shí), 大吸收光譜在 471 nm,結(jié)合 DNA 時(shí)的大吸收光譜在 500 nm,大發(fā)射光譜在 530 nm。

四、數(shù)據(jù)處理

12.以陽(yáng)性對(duì)照濃度的 log 值為橫軸,以 Ct 值為縱軸,繪制標(biāo)準(zhǔn)曲線。再以待測(cè)樣品

的 Ct 值從標(biāo)準(zhǔn)曲線上推算出樣品 DNA 濃度的 log 值,再推算出其濃度。

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