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有了這一篇,再也不用問別人,WB蛋白樣品制備常見問題大全!
閱讀:1728 發(fā)布時間:2021-9-8一直都在做蛋白研究,但是樣品制備中的小細節(jié)你都了解嗎?這里為大家整理了蛋白樣品制備中大大小小的常見問題,一起來學(xué)習(xí)吧!
兩種方式都是可行的,各有利弊。不必擔(dān)心刮刀收集會刮壞細胞,胰酶消化的程度掌握不好,也會讓細胞破損。胰酶消化可能會對某些膜蛋白產(chǎn)生影響,刮刀收集效率會略低,可根據(jù)自己的實驗來選擇細胞收集的方式。做總蛋白提取時,可選擇直接在器皿中進行裂解,無需提前收集。
PS:使用刮刀收集時,可加入PBS幫助收取細胞。
當然不是,要根據(jù)WB的實驗?zāi)康膩泶_定提取哪類蛋白,如需驗證某些低豐度蛋白,或蛋白定位,或組分間表達量對比,則需要進行亞細胞結(jié)構(gòu)分離或組分分離。
蛋白樣品如果長期保存,或者下游實驗過程較長,建議加入蛋白酶抑制劑。做磷酸化研究,一定要加入磷酸酶抑制劑!
內(nèi)源性蛋白酶存在于胞漿中,所以要在細胞裂解前加入抑制劑到達最佳抑制效果,提取時將抑制劑添加到裂解液中,工作濃度1X。例如100X蛋白酶抑制劑,1ml裂解液中添加10ul即可。
產(chǎn)生粘稠物的主要原因是RIPA不能將所有樣品全部裂解,產(chǎn)生的不可溶組分中主要含有核酸殘團,細胞碎片(有些組織樣品還含有油脂),和部分蛋白,因此RIPA提取的僅僅是可溶性蛋白,并非真正的總蛋白。
解決方案:使用柱式法蛋白提取真正意義上的總蛋白
最好是收集完細胞后馬上進行蛋白提取。
濃度測定方法很多,目前推薦使用兼容性較好的BCA法進行濃度測定。
蛋白樣品不建議久存,也不要反復(fù)凍融。下游做WB實驗,建議蛋白濃度測定后,加入loading buffer煮樣,煮后根據(jù)實驗需要分裝成小管在-80℃,下次使用前拿出小管再次煮樣即可。(詳
蛋白濃度測定后,建議將各個樣品稀釋到某一固定濃度(稀釋可以PBS,水或裂解液),加入loading buffer后,在沸水中煮3-5分鐘,使蛋白充分變性,也可使用PCR儀95度加熱5分鐘。
PS:煮沸并非必須步驟,膜蛋白建議70℃或者更低溫度煮。
煮后在冰上靜置少許時間,進行低速離心,即可上樣。
如組織樣品中含血較多,血紅蛋白可能會影響下游實驗, 可以在組織樣品裂解前使用紅細胞裂解液進行處理后,再進行蛋白提取。