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當(dāng)前位置:武漢艾美捷科技有限公司>>技術(shù)文章>>今天我們就來聊聊活細(xì)胞的DNA染色~
目前,在活細(xì)胞的DNA染色中,有兩組染料。組是Hoechst系列,它們具有細(xì)胞滲透性和熒光性(即低熒光直到結(jié)合靶DNA),但由于340-360nm范圍內(nèi)短紫外-藍(lán)色波長激發(fā)的要求,它們具有相當(dāng)?shù)?/span>毒性。
第二組活細(xì)胞染料由遠(yuǎn)紅外染料組成,如SiR-DNA™、Syto61™、Draq5™或Vybrant®Dyecycle™Ruby。這些染料克服了前一組光譜范圍的限制,允許使用波長約為650nm、發(fā)射波長約為700nm的低能激發(fā)光。這種光具有小的光毒性(SiR-Tubulin™和SiR-Actin™)并且細(xì)胞或組織樣品在該光譜范圍內(nèi)不吸收光也不自發(fā)熒光,這使得在厚樣本中有更深處成像成為可能。
SiR-DNA™(SiR–Hoechst)是基于熒光團(tuán)硅羅丹明(SiR)和DNA小槽粘合劑雙苯甲酰亞胺(Hoechst)組合而成,它比遠(yuǎn)紅外染料組其他染料更具優(yōu)勢。
SiR–Hoechst(SiR-DNA™) 和其他遠(yuǎn)紅外DNA染料長時間活細(xì)胞成像對比圖,顯示SiR–Hoechst的低毒性及熒光穩(wěn)定性
市面上幾種常見DNA染料對比
特性 | SiR-DNA™ | 其他遠(yuǎn)紅外染料 | 短波長染料 | |
Hoechst™ | DAPI、EB | |||
細(xì)胞毒性 | 8小時內(nèi)持續(xù)使用對細(xì)胞無影響 | 廠家建議使用的濃度下對細(xì)胞顯示出強(qiáng)烈的毒性作用(細(xì)胞停止分裂或死亡) | 適用于活細(xì)胞,但細(xì)胞毒性高, | 不適于活細(xì)胞,且EB致使細(xì)胞突變 |
細(xì)胞滲透性 | 有細(xì)胞滲透性 | 有細(xì)胞滲透性 | 有細(xì)胞滲透性 | 無細(xì)胞滲透性 |
特異性 | 針對于活細(xì)胞DNA,特異性非常好 | Syto61™、Draq5™或Vybrant®Dyecycle™染料在活細(xì)胞的DNA以外的其他結(jié)構(gòu)上產(chǎn)生強(qiáng)烈的非特異性信號 | 很高的吸收率和自發(fā)熒光,背景較高 | |
超分辨率顯微鏡兼容性 | 在多次暴露于激發(fā)光下信號仍然很強(qiáng) | Syto61與超分辨顯微鏡兼容,但其高背景熒光和細(xì)胞毒性 | 不適合超分辨率分析 |
注:SiR-DNA™是Spirochrome SA公司的商標(biāo) (瑞士)
Vybrant® DyeCycle™ Ruby stain 和Syto61™是美國Thermo Fisher Scientific公司的商標(biāo)
DRAQ5™是Biostatus公司商標(biāo)
Hoechst™是美國Sanofi公司商標(biāo)
SiR-DNA™的主要發(fā)展方向是將熒光特性、高DNA特異性、低毒性與遠(yuǎn)紅外激發(fā)/發(fā)射范圍相結(jié)合。此外,由于其穩(wěn)定性和對遠(yuǎn)紅光的特性,探針在超分辨顯微鏡(STDE和SIM)中表現(xiàn)非常好。因此,SiR-DNA™是一種優(yōu)良的探針,其性能與SiR-tubulin和SiR-actin一樣。
在顯微鏡觀察和高通量篩選過程中,SiR-DNA™可以在不受紫外線刺激的情況下進(jìn)行簡單的核復(fù)染。在流式細(xì)胞術(shù)過程中,SiR-DNA™可以直接用于血液/BM的表型分析和細(xì)胞DNA含量分析,而無需紅細(xì)胞溶解或固定、滲透或RNase處理等步驟。
說了這么多,您有沒有對SiR-DNA™活細(xì)胞染料很心動了?作為專業(yè)的生命科學(xué)解決方案供應(yīng)商,艾美捷科技為您推薦的活細(xì)胞DNA染色試劑盒:
產(chǎn)品名稱 | Ex/Em | 濾光鏡 | 貨號 |
SiR-DNA Kit | 652/672nm | 標(biāo)準(zhǔn)Cy5設(shè)置 | CY-SC007 |
* 試劑盒均內(nèi)含Verapamil(維拉帕米,戊脈安),一種廣譜的外排泵抑制劑。
廠家質(zhì)檢:
常見問題整理:
是否兼容固定細(xì)胞?
SiR-DNA™可以與甲醇或PFA固定的細(xì)胞一起使用。然而,介質(zhì)對SiR-DNA™的亮度有很大的影響。當(dāng)混有PBS或Vectashield®的細(xì)胞產(chǎn)生很低的信號,混合有純甘油的細(xì)胞會染出非常明亮的細(xì)胞核。因此,我們建議在用SiR-DNA™染色固定細(xì)胞時使用純甘油作為介質(zhì)。
哪些物種的樣本和組織能被SiR探針染色?
下方僅引述已報告起作用的細(xì)胞系、組織或生物體。
智人:U2OS,成纖維細(xì)胞,HeLa,HUVEC, MCF-10A, HCT-116, A549,紅細(xì)胞
肌肉:C2C12,IA32,骨骼肌,原代心肌細(xì)胞,原代卵母細(xì)胞
褐家鼠:初級海馬神經(jīng)元、初級皮質(zhì)神經(jīng)元、NRK
風(fēng)信子:COS-7
金鯽:BHK
黑腹果蠅:Notum上皮,S2
迪德爾菲斯有袋動物:OK細(xì)胞
為什么SiR探針的背景比其他熒光團(tuán)低?
SiR探針使用的是近紅外/遠(yuǎn)紅外光譜范圍內(nèi)的激發(fā)光,從而避免較短波長的光產(chǎn)生自發(fā)熒光,從而避免產(chǎn)生較高的背景。SiR耦合探針具有兩種物理狀態(tài):①非熒光,關(guān)閉狀態(tài)(spirolactone)和②高熒光,開啟狀態(tài)(zwitterion)。探針與其配體目標(biāo)的結(jié)合有利于高熒光的開放狀態(tài),而未結(jié)合探針則存在于封閉、非熒光狀態(tài)(下圖)。從未結(jié)合態(tài)到結(jié)合態(tài)熒光放大率增加100倍。這就產(chǎn)生了一種高度敏感的生物傳感器,其中大部分熒光只發(fā)生在結(jié)合態(tài)。
SiR衍生物在熒光(開放)型(左結(jié)構(gòu))和非熒光(封閉)型(右結(jié)構(gòu))之間存在平衡
Nature Communication專屬產(chǎn)品文章精彩了解:
G. Lukinavicius et al.,SiR–Hoechst is a far-red DNA stain for live-cell nanoscopy, Nat. Commun. 6:8497 doi: 10.1038/ncomms9497 (2015).
不同類型細(xì)胞DNA成像圖,4μm SiR–Hoechst
SiR-Hoechst染色HeLa細(xì)胞的共聚焦(confocal)和電鏡(STED)對比
Cytoskeleton公司成立于1993年,專注于生物化學(xué)和細(xì)胞過程研究中的純化蛋白和便捷試劑盒開發(fā)與生產(chǎn)。公司提供藥物篩選、信號轉(zhuǎn)導(dǎo)、蛋白質(zhì)轉(zhuǎn)錄后修飾(PTM)、細(xì)胞骨架研究相關(guān)的系列試劑盒和產(chǎn)品,尤其以細(xì)胞骨架相關(guān)研究見長,既能滿足于樣品較少的科學(xué)研究,也可以用于小規(guī)模篩選研究和高通量大規(guī)模篩選研究。
目前主要的產(chǎn)品有340余種,其產(chǎn)品主要覆蓋肌動蛋白,微管蛋白,馬達(dá)蛋白,小G蛋白,細(xì)胞外基質(zhì),活細(xì)胞成像等相關(guān)領(lǐng)域,提供對應(yīng)的蛋白質(zhì),抗體,檢測與分析試劑盒,并且產(chǎn)品線還在不斷的擴(kuò)大中。此外,公司還提供微管蛋白,肌動蛋白,小G蛋白,GAPs,GEFs等現(xiàn)有產(chǎn)品的藥物篩選服務(wù)。
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