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同濟大學Cell發(fā)布干細胞重要研究成果
閱讀:870 發(fā)布時間:2015-5-25來自同濟大學醫(yī)學院、加州大學洛杉磯分校、南昌大學等處的研究人員報告稱,他們利用單細胞RNA測序技術(shù),同時運用加權(quán)基因共表達網(wǎng)絡分析(WGCNA),揭示出了激活休眠神經(jīng)干細胞的信號。這一重要的研究結(jié)果發(fā)布在5月21日的《細胞》(Cell)雜志上。
同濟大學醫(yī)學院的李思光(Siguang Li)教授以及孫毅(Yi Eve Sun)教授是這篇論文的共同工作。李思光教授主要從事細胞分化過程中的表觀遺傳調(diào)控機理研究,著重研究干細胞定向分化過程中的非編碼RNA調(diào)控網(wǎng)絡和RNA介導的DNA甲基化調(diào)控機制。孫毅教授的主要研究方向是神經(jīng)系統(tǒng)發(fā)育和疾病的表觀遺傳學及分子機制研究(延伸閱讀:中國學者Cell stem cell基因編輯突破性成果 )。
成體哺乳動物大腦中的神經(jīng)發(fā)生貫穿整個生命周期。神經(jīng)干細胞的分化及自我更新是這一過程的基礎并對神經(jīng)組織的修復和維持起著重要作用。許多神經(jīng)退行性疾病也與其功能的失調(diào)相關。深入研究成體神經(jīng)干細胞zui終將有助于干細胞治療方案的確定。然而由于成體神經(jīng)干細胞相對稀缺以及它們周圍環(huán)境的復雜性,使得確定這些細胞的分子生物學性狀尤其具有挑戰(zhàn)性。
單細胞RNA測序(single-cell RNA-sequencing, SCRS)是分析單個細胞或微量RNA中基因組表達的一個強有力的技術(shù)。與微陣列技術(shù)相比, SCRS能檢測出更多的轉(zhuǎn)錄組, 靈敏度更高; 既能分析同一基因的多個轉(zhuǎn)錄本及其對應的蛋白類型, 也能檢測已知基因中新的剪接點; 還具有準確度高、噪音低等優(yōu)點。近年來研究人員開始利用這一技術(shù)來克服研究中起始樣本量少的瓶頸。
在這篇Cell文章中作者們報告稱通過采用單細胞RNA測序技術(shù),同時運用加權(quán)基因共表達網(wǎng)絡分析(WGCNA),揭示出了成年小鼠前腦神經(jīng)發(fā)生區(qū)域CD133+/GFAP?室管膜(E)細胞的分子特征。令人驚訝的是,他們發(fā)現(xiàn)室管膜CD133+/GFAP?休眠細胞*基因網(wǎng)絡中的重要樞紐基因,包含較多的免疫應答基因以及血管生成因子受體編碼基因。給予血管內(nèi)皮生長因子(VEGF)可激活側(cè)腦室以及第四腦室CD133+室管膜神經(jīng)干細胞(NSCs),加上堿性成纖維生長因子(bFGF)則誘導了隨后的神經(jīng)譜系分化和遷移。