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被烷基化或脫氨基的DNA堿基，在一個(gè)保護(hù)基因組完整性、但同時(shí)又會(huì)干預(yù)癌癥烷基化療法的過(guò)程中被DNA糖基化酶（修復(fù)酶）清除。迄今所研究的DNA糖基化酶采用一個(gè)被修飾的堿基插入活性點(diǎn)的機(jī)制。

現(xiàn)在，zui近發(fā)現(xiàn)的DNA糖基化酶AlkD的結(jié)構(gòu)已被確定，并且也顯示了一個(gè)非常不同的機(jī)制。按這種機(jī)制，被修飾的堿基從一個(gè)“螺旋外”位置伸出，這個(gè)位置只使N3- 和N7-被烷基化的堿基發(fā)生解理。

DNA與AlkD的串聯(lián)HEAT重復(fù)段的相互作用使DNA 骨干發(fā)生扭曲，從而使“非Watson–Crick堿基對(duì)”能夠被檢測(cè)到。AlkD酶在細(xì)菌、古細(xì)菌、植物和真核生物中普遍存在，這便提出了一個(gè)有趣的問(wèn)題：為什么消除基因組烷基化損傷會(huì)有另一種機(jī)制？（生物谷）