基于DIA/SWATH的蛋白質(zhì)翻譯后修飾定量分析檢測(cè)技術(shù)服務(wù)詳情介紹

dànbáizhì翻譯后修飾（Post-Translational Modifications, PTMs）在調(diào)控細(xì)胞功能、信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)、代謝過(guò)程及疾病發(fā)生中扮演著核心角色。磷酸化、乙?；⒎核鼗?、甲基化等修飾形式，為dànbáizhì賦予了時(shí)空特異性和功能多樣性，是理解蛋白功能狀態(tài)的重要線索。隨著質(zhì)譜技術(shù)的發(fā)展，數(shù)據(jù)獨(dú)立采集（Data-Independent Acquisition, DIA）尤其是SWATH-MS（Sequential Windowed Acquisition of All Theoretical Fragment Ion Mass Spectra）策略，正在成為PTM定量研究的重要手段，以其高通量、高重復(fù)性、無(wú)偏性等特點(diǎn)，助力科研人員實(shí)現(xiàn)對(duì)復(fù)雜生物樣本中修飾蛋白的系統(tǒng)解析。

一、dànbáizhì翻譯后修飾的復(fù)雜性與挑戰(zhàn)

dànbáizhì翻譯后修飾具有高度復(fù)雜性。一方面，多種修飾類型可作用于同一蛋白甚至同一氨基酸殘基上，形成調(diào)控的協(xié)同或拮抗作用；另一方面，修飾通常以低豐度存在，且變化迅速，受細(xì)胞狀態(tài)、外部刺激和發(fā)育階段影響顯著。此外，修飾位點(diǎn)的異構(gòu)性也對(duì)分析提出了更高的分辨需求。在識(shí)別和定量這類修飾分子時(shí)，常受限于數(shù)據(jù)獲取的片段性和樣本重復(fù)性不高等問(wèn)題，難以滿足系統(tǒng)性研究的需求?；贒IA/SWATH的質(zhì)譜采集方式，恰好以其覆蓋全面、定量jīngquè的特性，為翻譯后修飾研究打開(kāi)了新的可能性。

二、DIA/SWATH-MS：構(gòu)建高維度的修飾dànbáizhì組數(shù)據(jù)

DIA/SWATH技術(shù)的基本原理是將整個(gè)質(zhì)譜掃描范圍劃分為若干窗口，依次對(duì)所有窗口內(nèi)的前體離子進(jìn)行同步碎裂，并采集其全部MS/MS信息。這種采集策略不依賴前體強(qiáng)度，不會(huì)遺漏低豐度信號(hào)，能夠在同一次分析中獲取完整的片段譜圖，從而實(shí)現(xiàn)對(duì)樣本中所有可檢測(cè)肽段的無(wú)偏分析。

在翻譯后修飾研究中，這種采集模式帶來(lái)了三大關(guān)鍵優(yōu)勢(shì)：

1、全面性與一致性

所有樣本在相同條件下均被采集相同的數(shù)據(jù)維度，顯著提升了不同實(shí)驗(yàn)批次、不同處理組間數(shù)據(jù)的可比性和穩(wěn)定性。這對(duì)于動(dòng)態(tài)修飾事件的追蹤，如藥物處理、細(xì)胞周期、炎癥應(yīng)答等研究場(chǎng)景尤為重要。

2、位點(diǎn)級(jí)別的修飾信息捕獲

PTM定量的核心不僅在于檢測(cè)修飾肽段，更在于jīngquè定位修飾位點(diǎn)。DIA數(shù)據(jù)的高覆蓋度使得研究人員可以借助高質(zhì)量的譜圖庫(kù)或預(yù)測(cè)算法，對(duì)修飾位點(diǎn)進(jìn)行準(zhǔn)確判定，實(shí)現(xiàn)從肽段層面向位點(diǎn)層面的深入拓展。

3、適配復(fù)雜樣本和多條件比較

在多組樣本、多種處理?xiàng)l件的大規(guī)模實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)中，DIA數(shù)據(jù)具有良好的批間一致性和高通量處理能力，可有效支持多變量統(tǒng)計(jì)分析、時(shí)間序列建模和系統(tǒng)生物學(xué)網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建。

三、DIA在翻譯后修飾研究中的關(guān)鍵流程

DIA/SWATH技術(shù)的高效運(yùn)用，需依賴一整套優(yōu)化流程，從樣本前處理到數(shù)據(jù)分析，環(huán)環(huán)相扣。

1、修飾肽段的特異性富集

翻譯后修飾常表現(xiàn)為低豐度、短暫且易受環(huán)境影響。為增強(qiáng)其在質(zhì)譜中的檢測(cè)能力，富集策略是dìyī道“篩選門檻”。例如，磷酸化通常使用金屬離子親和層析（IMAC）或èryǎnghuàtài（TiO?）富集，乙?；c泛素化則常依賴于特異性抗體進(jìn)行免疫富集。高選擇性與低非特異性結(jié)合率，是確保DIA分析成功的基礎(chǔ)。

2、DIA譜圖庫(kù)構(gòu)建與修飾信息整合

在DIA分析中，譜圖庫(kù)是實(shí)現(xiàn)修飾肽段識(shí)別與定量的核心資源?？刹捎脙煞N方式進(jìn)行構(gòu)建：

• 實(shí)驗(yàn)譜庫(kù)：通過(guò)前期DDA實(shí)驗(yàn)獲取修飾肽段的碎片譜圖，構(gòu)建針對(duì)性強(qiáng)的定制庫(kù)；

• 預(yù)測(cè)譜庫(kù)：利用機(jī)器學(xué)習(xí)模型（如Prosit、DIA-NN）根據(jù)肽段序列預(yù)測(cè)其MS/MS特征，快速生成大規(guī)模、高覆蓋率的修飾譜庫(kù)。

高質(zhì)量的譜圖庫(kù)，能顯著提升修飾肽段的檢出率和定量精度，尤其對(duì)于未知修飾位點(diǎn)的探索具有重要意義。

3、數(shù)據(jù)分析與生物學(xué)解釋

PTM數(shù)據(jù)分析不僅關(guān)注定量水平的變化，更強(qiáng)調(diào)生物學(xué)意義的挖掘。例如：

• 位點(diǎn)特異性差異分析：識(shí)別在不同條件下顯著變化的修飾位點(diǎn)；

• 修飾網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建：解析特定修飾類型在信號(hào)通路、轉(zhuǎn)錄調(diào)控中的參與角色；

• 修飾間交互研究：探索磷酸化與乙?；?、泛素化之間的協(xié)同或競(jìng)爭(zhēng)作用。

目前，已有多種專門用于DIA數(shù)據(jù)的分析軟件支持PTM研究（如Spectronaut、DIA-NN、Skyline），可幫助科研人員從復(fù)雜數(shù)據(jù)中提取具有生物學(xué)意義的修飾信號(hào)。

基于DIA/SWATH的dànbáizhì翻譯后修飾定量分析使研究者能夠在大規(guī)模樣本中穩(wěn)定、準(zhǔn)確地識(shí)別和量化修飾位點(diǎn)，推動(dòng)生命科學(xué)從“結(jié)構(gòu)識(shí)別”走向“功能解碼”。百泰派克生物科技致力于為科研工作者提供高質(zhì)量的SWATH定量蛋白組學(xué)服務(wù)，助力探索蛋白修飾的精細(xì)調(diào)控機(jī)制，共同推進(jìn)生命科學(xué)的邊界。

百泰派克生物科技特色項(xiàng)目

一、蛋白測(cè)序

百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos質(zhì)譜儀及島津公司埃德曼降解測(cè)序系統(tǒng)對(duì)dànbáizhì序列進(jìn)行分析，提供基于質(zhì)譜的蛋白測(cè)序分析服務(wù)，包括對(duì)dànbáizhì的氨基酸組成分析，Nduāncèxù，Cduāncèxù和全序列分析，以及基于埃德曼降解的dànbáizhìN端序列分析服務(wù)。對(duì)于未知理論序列的dànbáizhì，提供基于從頭測(cè)序法的dànbáizhì從頭測(cè)序服務(wù)，對(duì)蛋白序列進(jìn)行分析。

※服務(wù)優(yōu)勢(shì)：

1.采用目前世界上優(yōu)良的質(zhì)譜儀器 Obitrap Fusion Lumos;

2.可實(shí)現(xiàn)對(duì)所測(cè)定靶蛋白序列 100% 的覆蓋;

3.可測(cè)定蛋白N端多達(dá) 70個(gè)氨基酸序列;

4.可測(cè)定多種形式的樣品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白條帶;

5.樣品用量低: 蛋白樣品僅需 5-10ug，即可完成檢測(cè);

6.測(cè)序不受N端封閉，PEC和和糖基化等N端修飾的影響。

二、dànbáizhì組學(xué)

百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos質(zhì)譜平臺(tái)結(jié)合Nano-LC，提供定量dànbáizhì組學(xué)、靶向dànbáizhì組學(xué)、多肽組學(xué)、翻譯后修飾蛋白組學(xué)等多種dànbáizhì組學(xué)分析服務(wù)。此外，百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4Ddànbáizhì組學(xué)服務(wù)，助力微量樣本蛋白組學(xué)、大樣本群醫(yī)學(xué)及高通量修飾組學(xué)等研究工作。

※服務(wù)優(yōu)勢(shì)：

1 .高通量定量蛋白分析:多對(duì)照組大規(guī)模實(shí)驗(yàn)分析，發(fā)現(xiàn)新的生物標(biāo)記物;

2.體內(nèi)體外多種dànbáizhì標(biāo)記方法，適用于分析組織、細(xì)胞、血液等多種樣品;

3.質(zhì)譜分析靈敏度高，實(shí)驗(yàn)結(jié)果重復(fù)度高;

4.可檢測(cè)較低豐度蛋白，線性范圍廣;

5.zhuānyè生物信息學(xué)分析，分析更系統(tǒng)準(zhǔn)確。

三、單細(xì)胞質(zhì)譜流式技術(shù)分析

百泰派克生物科技采用Fluidigm質(zhì)譜流式系統(tǒng)進(jìn)行單細(xì)胞質(zhì)譜流式技術(shù)分析，采用金屬元素標(biāo)記物（通常是金屬元素標(biāo)記的特異抗體）標(biāo)記細(xì)胞表面和內(nèi)部的分子，然后用流式細(xì)胞原理分離單個(gè)細(xì)胞，再用電感耦合等離子體質(zhì)譜（ICP-MS）分析單個(gè)細(xì)胞的原子質(zhì)量譜，zuì后將原子質(zhì)量譜數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換為細(xì)胞表面和內(nèi)部的信號(hào)分子表達(dá)量。

※服務(wù)優(yōu)勢(shì)：

1.技術(shù)優(yōu)良，*技術(shù)空白

采用金屬標(biāo)記抗體技術(shù)，避免了傳統(tǒng)流式熒光通道少且易相互影響的問(wèn)題?？稍趩渭?xì)胞層面上對(duì)多種指標(biāo)同時(shí)進(jìn)行表征，百泰派克生物科技可做到同時(shí)檢測(cè)51個(gè)目標(biāo)蛋白。

2.分析數(shù)量大，成本較低

單細(xì)胞RNAseq受成本等因素限制，所有樣本細(xì)胞匯總的分析數(shù)目一般在2x10^4個(gè)左右，而流式質(zhì)譜技術(shù)一次（單樣本）就可分析至少10^5的細(xì)胞，實(shí)現(xiàn)了數(shù)量級(jí)的提高，且成本不高于單細(xì)胞RNAseq。

3.應(yīng)用前景大

①流式質(zhì)譜結(jié)果可以給出細(xì)胞亞群的變化，在臨床診斷、疾病機(jī)制研究等方面具有極大的研究前景；

②將金屬標(biāo)簽技術(shù)與其他技術(shù)結(jié)合會(huì)有新應(yīng)用方向。除常規(guī)蛋白外，質(zhì)譜流式細(xì)胞技術(shù)還可用于蛋白翻譯后修飾；

③可檢測(cè)細(xì)胞存活率、細(xì)胞大小、mRNA轉(zhuǎn)錄子表達(dá)量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。

四、基于高精度質(zhì)譜的免疫多肽組學(xué)分析及新抗原發(fā)現(xiàn)

百泰派克生物科技的基于高精度質(zhì)譜的免疫多肽組學(xué)分析及新抗原發(fā)現(xiàn)一站式解決方案包括我們專有的、高度敏感的免疫肽富集和鑒定方案。我們能夠幫助您實(shí)現(xiàn)10,000個(gè)以上I型多肽和10,000個(gè)以上II型多肽的鑒定和識(shí)別。通過(guò)我們優(yōu)化的高通量免疫多肽組學(xué)分析平臺(tái)進(jìn)行免疫肽組學(xué)分析，可從zuì小的樣品材料中進(jìn)行可重復(fù)的識(shí)別和定量。該服務(wù)可以應(yīng)用于大規(guī)模的研究，旨在助力科研工作者尋找癌癥、免疫疾病及傳染病的解決方案，深入挖掘未知的靶標(biāo)。

五、生物藥物表征

百泰派克基于高分辨率質(zhì)譜技術(shù)，MALDI TOF，高效色譜分離技術(shù)，提供一系列完善的生物藥物分析方案，從dànbáizhì、多肽、抗體、疫苗等生物制品的氨基酸組成和一級(jí)結(jié)構(gòu)分析，到產(chǎn)品變異性和純度分析。旨在提供優(yōu)質(zhì)生物藥物分析服務(wù)，幫助生物醫(yī)藥生產(chǎn)商提高生物藥物品質(zhì)。

百泰派克生物科技七大檢測(cè)平臺(tái)

百泰派克生物科技-生物制品表征，生物質(zhì)譜多組學(xué)優(yōu)質(zhì)服務(wù)商

北京百泰派克生物科技有限公司致力于為生物/制藥和醫(yī)療器械行業(yè)提供質(zhì)量控制檢測(cè)和項(xiàng)目驗(yàn)證等zhuānyè服務(wù)。公司實(shí)驗(yàn)室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法規(guī)和指導(dǎo)原則，通過(guò)CNAS/ISO9001雙重質(zhì)量體系認(rèn)證，建立了完備的質(zhì)量體系，數(shù)據(jù)冷熱/異地備份，設(shè)備定期計(jì)量/期間核查，軟件審計(jì)追蹤，為客戶提供一體化解決方案和技術(shù)服務(wù)，支持新藥研發(fā)、藥物申報(bào)注冊(cè)和生產(chǎn)放行。

1.公司采用ISO9001質(zhì)量控制體系，zhuānyè提供以質(zhì)譜為基礎(chǔ)的CRO檢測(cè)分析服務(wù)；

2.獲國(guó)家CNAS實(shí)驗(yàn)室認(rèn)可，為客戶提供符合全球藥政法規(guī)的藥物質(zhì)量研究服務(wù)；

3.業(yè)務(wù)范圍覆蓋dànbáizhì組學(xué)、多肽組學(xué)、代謝組學(xué)、生物藥物表征、單細(xì)胞分析、單細(xì)胞質(zhì)譜流式、生信云分析以及多組學(xué)生物質(zhì)譜整合分析等；

4.七大質(zhì)量控制檢測(cè)平臺(tái)，滿足您一站式服務(wù)需求；

5.服務(wù)3000+企業(yè)，10000+客戶的選擇；

6.致力于為您提供優(yōu)質(zhì)的生物質(zhì)譜分析服務(wù)!

基于DIA/SWATH的蛋白質(zhì)翻譯后修飾定量分析檢測(cè)技術(shù)服務(wù)詳情介紹