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研究揭示維持DNA甲基化和基因組穩(wěn)定的新機(jī)制
2021年09月18日 13:41:02 來源:中國科學(xué)院分子植物科學(xué)卓越創(chuàng) 點(diǎn)擊量:7326

中國科學(xué)院分子植物科學(xué)卓越創(chuàng)新中心研究員朱健康研究組d 研究揭示一種維持植物DNA甲基化和基因組穩(wěn)定的新機(jī)制。

  【化工儀器網(wǎng) 項(xiàng)目成果】哺乳動物還是植物,其基因組上胞嘧啶堿基第5個(gè)碳原子上都存在甲基化(-CH3)的修飾。除了正常的基因以外,基因組中還存在大量的跳躍基因,活躍的跳躍基因?qū)τ谏飩€(gè)體是危險(xiǎn)的,這是由于它們的移動會破壞基因組的結(jié)構(gòu)。
 
  DNA甲基化修飾的核心功能是“殺死”這些跳躍基因,讓它們一直處于被抑制的狀態(tài)。因而,生物個(gè)體是如何維持跳躍基因上面致密的DNA甲基化修飾是表觀遺傳領(lǐng)域中的重要研究方向。
 
  近日,PNAS在線發(fā)表了中國科學(xué)院分子植物科學(xué)卓越創(chuàng)新中心研究員朱健康研究組完成的題為Pathway conversion enables a double-lock mechanism to maintain DNA methylation and genome stability的研究論文。該研究揭示一種維持植物DNA甲基化和基因組穩(wěn)定的新機(jī)制。
 
  植物中,多種DNA甲基化調(diào)控通路合作維持不同基因組位置的跳躍基因上致密的DNA甲基化狀態(tài)。此前,一個(gè)“靜止”模型被普遍接受,即基因組中給定的跳躍基因其DNA甲基化是由特定的途徑維持,如尺寸較長的跳躍基因的中間部分的CHH甲基化由CMT2維持;而其邊緣部分和短尺寸的跳躍基因的CHH甲基化則由RNA介導(dǎo)的DNA甲基化(RdDM)途徑維持。
 
  不同于先前的模型,在本研究中,研究發(fā)現(xiàn)染色質(zhì)重塑因子DDM1突變后,接近1000個(gè)CMT2維持DNA甲基化的位點(diǎn)轉(zhuǎn)變?yōu)镽dDM途徑維持,表明在某些情況下,對于給定位點(diǎn)DNA甲基化的維持并不是一成不變的,而是可以靈活轉(zhuǎn)換的,因而DNA甲基化的維持途徑在給定位點(diǎn)是可修改的??蒲腥藛T將這個(gè)機(jī)制命名為CMT2-至-RdDM通路。進(jìn)一步,研究通過多突變體阻斷CMT2到RdDM通路的轉(zhuǎn)換發(fā)現(xiàn)大量的跳躍基因被激活,且在相應(yīng)的突變體中跳躍,表明通路轉(zhuǎn)換對于維持基因組的穩(wěn)定是必須的。
 
  研究提出一種“雙保險(xiǎn)”設(shè)想:RdDM通路功能缺乏時(shí),染色質(zhì)重塑因子DDM1依賴的DNA甲基化維持途徑保證跳躍基因處于沉默狀態(tài);當(dāng)DDM1功能缺乏時(shí),RdDM途徑包括新發(fā)現(xiàn)的CMT2-至-RdDM途徑能夠抑制跳躍基因。
 
  研究工作得到中科院的資助。
 
分子植物卓越中心揭示維持DNA甲基化和基因組穩(wěn)定的新機(jī)制
 
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